69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2603 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 729 aa  1523    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  45.24 
 
 		 689 aa  511  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  43.33 
 
 		 688 aa  462  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  41.85 
 
 		 670 aa  451  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  33.47 
 
 		 662 aa  398  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  36.29 
 
 		 616 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  36.35 
 
 		 616 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  36.39 
 
 		 618 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  36.09 
 
 		 619 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  33.29 
 
 		 688 aa  378  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  37.34 
 
 		 615 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  36.11 
 
 		 618 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  33.57 
 
 		 655 aa  348  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  30.31 
 
 		 658 aa  298  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  29.13 
 
 		 757 aa  272  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  28.72 
 
 		 566 aa  195  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  28.75 
 
 		 571 aa  195  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  28.72 
 
 		 566 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  28.8 
 
 		 577 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  34.96 
 
 		 236 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  32.08 
 
 		 241 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  32.08 
 
 		 241 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  32.08 
 
 		 241 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  31.12 
 
 		 247 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  29.09 
 
 		 346 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  29.09 
 
 		 346 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  33.77 
 
 		 346 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  29.09 
 
 		 346 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  44.23 
 
 		 211 aa  88.2  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  26.44 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1338  cytochrome c family protein  43.24 
 
 		 75 aa  67.4  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.207335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  26.78 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  25.56 
 
 		 883 aa  57.8  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  24.1 
 
 		 655 aa  57.4  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 266 aa  54.7  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  25.57 
 
 		 359 aa  54.7  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  25.31 
 
 		 884 aa  54.3  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  29.71 
 
 		 359 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  27.74 
 
 		 789 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  22.22 
 
 		 806 aa  53.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  27.45 
 
 		 270 aa  52  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  29.17 
 
 		 266 aa  51.6  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  23.86 
 
 		 413 aa  51.6  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  27.24 
 
 		 646 aa  51.2  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  25.19 
 
 		 307 aa  51.2  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  22.72 
 
 		 712 aa  51.2  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  28.93 
 
 		 270 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  35.42 
 
 		 270 aa  50.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  24.22 
 
 		 349 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0573  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.16 
 
 		 208 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1901  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.16 
 
 		 208 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  28.37 
 
 		 372 aa  48.5  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1681  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.6 
 
 		 208 aa  47.8  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0728  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.6 
 
 		 208 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2712  hypothetical protein  25.93 
 
 		 366 aa  47.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2257  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.6 
 
 		 208 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2394  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.6 
 
 		 208 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0099056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  26.99 
 
 		 489 aa  47.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  25.6 
 
 		 413 aa  47.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1694  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.6 
 
 		 208 aa  47  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  24.51 
 
 		 678 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2898  cytochrome c family protein  25.85 
 
 		 330 aa  46.6  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808902  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  25.47 
 
 		 487 aa  45.8  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  21.66 
 
 		 436 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  23.58 
 
 		 442 aa  45.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  23.99 
 
 		 304 aa  45.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  23.2 
 
 		 211 aa  44.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0709  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.6 
 
 		 208 aa  44.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2808  cytochrome c family protein  28.76 
 
 		 189 aa  44.3  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000226609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>