25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2087 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  921    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  35.86 
 
 		 457 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  34.66 
 
 		 490 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  33.18 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  32.17 
 
 		 488 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  32.28 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  29.91 
 
 		 485 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  27.64 
 
 		 595 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  23.65 
 
 		 663 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.95 
 
 		 906 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3444  hypothetical protein  26.28 
 
 		 459 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166801  normal  0.529515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 942 aa  90.1  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6647  Tetratricopeptide TPR_4  22.9 
 
 		 739 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2276  hypothetical protein  23.76 
 
 		 735 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4639  hypothetical protein  22.86 
 
 		 536 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1063  hypothetical protein  22.93 
 
 		 640 aa  67.4  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000914446  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1691  hypothetical protein  22.17 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1880  hypothetical protein  25 
 
 		 934 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0271  hypothetical protein  23.2 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  23.32 
 
 		 687 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1692  hypothetical protein  21.87 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0069  hypothetical protein  22.29 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1762  hypothetical protein  21.72 
 
 		 305 aa  53.5  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2674  hypothetical protein  25 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  23.58 
 
 		 729 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>