14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1063 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1063  hypothetical protein  100 
 
 		 640 aa  1340    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000914446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0271  hypothetical protein  42.86 
 
 		 635 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4639  hypothetical protein  33.88 
 
 		 536 aa  250  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1880  hypothetical protein  27.27 
 
 		 934 aa  154  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  22.93 
 
 		 457 aa  90.1  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  25.24 
 
 		 485 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  23.56 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  23.61 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  23.04 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  23.46 
 
 		 595 aa  68.6  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  25.17 
 
 		 467 aa  66.6  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  22.93 
 
 		 442 aa  67  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  24.31 
 
 		 663 aa  51.2  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0069  hypothetical protein  22.78 
 
 		 434 aa  48.5  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>