17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4639 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4639  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1126    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1063  hypothetical protein  33.88 
 
 
640 aa  250  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000914446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0271  hypothetical protein  29.77 
 
 
635 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1880  hypothetical protein  24.95 
 
 
934 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  27.84 
 
 
490 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  27.47 
 
 
488 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  26.46 
 
 
485 aa  103  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  26.58 
 
 
490 aa  97.4  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  27.55 
 
 
595 aa  87  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  24.58 
 
 
457 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  23.21 
 
 
442 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  23.63 
 
 
467 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 
942 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  23.63 
 
 
663 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.97 
 
 
906 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2674  hypothetical protein  22.3 
 
 
412 aa  47.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2276  hypothetical protein  22.79 
 
 
735 aa  47  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>