20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1439 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  100 
 
 		 663 aa  1372    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2276  hypothetical protein  41.04 
 
 		 735 aa  486  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.62 
 
 		 906 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 942 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  23.77 
 
 		 595 aa  159  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  25.77 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  25.53 
 
 		 457 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  23.65 
 
 		 442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6647  Tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 		 739 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  24.9 
 
 		 490 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  22.83 
 
 		 490 aa  98.6  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  24.95 
 
 		 488 aa  97.1  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  24.85 
 
 		 485 aa  91.3  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1880  hypothetical protein  23.57 
 
 		 934 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3444  hypothetical protein  23.38 
 
 		 459 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166801  normal  0.529515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4639  hypothetical protein  23.63 
 
 		 536 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0069  hypothetical protein  29.19 
 
 		 434 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1063  hypothetical protein  24.09 
 
 		 640 aa  51.6  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000914446  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0999  hypothetical protein  20.85 
 
 		 368 aa  46.2  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  37.36 
 
 		 348 aa  44.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>