25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1584 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1228    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  28.5 
 
 
457 aa  183  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  27.64 
 
 
442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  23.77 
 
 
663 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.97 
 
 
906 aa  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  26.71 
 
 
467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  26.06 
 
 
490 aa  120  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2276  hypothetical protein  25.93 
 
 
735 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6647  Tetratricopeptide TPR_4  23.52 
 
 
739 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  22.5 
 
 
485 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  24.48 
 
 
490 aa  111  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  25.21 
 
 
488 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
942 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3444  hypothetical protein  25.12 
 
 
459 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166801  normal  0.529515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4639  hypothetical protein  27.55 
 
 
536 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1063  hypothetical protein  23.46 
 
 
640 aa  68.9  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000914446  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1692  hypothetical protein  22.1 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3059  hypothetical protein  23.92 
 
 
386 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  21.6 
 
 
687 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1691  hypothetical protein  24.94 
 
 
406 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2674  hypothetical protein  28.92 
 
 
412 aa  60.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1880  hypothetical protein  25.31 
 
 
934 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1311  hypothetical protein  24 
 
 
374 aa  58.2  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0023679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0069  hypothetical protein  19.75 
 
 
434 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0999  hypothetical protein  22.3 
 
 
368 aa  53.9  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>