24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1643 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  100 
 
 		 467 aa  975    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  36.85 
 
 		 490 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  35.31 
 
 		 485 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  36.18 
 
 		 490 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  36.71 
 
 		 488 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  32.54 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  32.88 
 
 		 442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  26.92 
 
 		 595 aa  143  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  26.19 
 
 		 663 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.18 
 
 		 906 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0271  hypothetical protein  29.71 
 
 		 635 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3444  hypothetical protein  24.94 
 
 		 459 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166801  normal  0.529515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2276  hypothetical protein  24.9 
 
 		 735 aa  94.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6647  Tetratricopeptide TPR_4  23.9 
 
 		 739 aa  83.6  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  21.98 
 
 		 942 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1880  hypothetical protein  26.63 
 
 		 934 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  26.67 
 
 		 687 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1063  hypothetical protein  25.17 
 
 		 640 aa  66.6  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000914446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4639  hypothetical protein  24.35 
 
 		 536 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1762  hypothetical protein  22.92 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0069  hypothetical protein  25.26 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1692  hypothetical protein  25.32 
 
 		 392 aa  53.1  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2450  hypothetical protein  27.27 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2674  hypothetical protein  23.95 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>