23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6647 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6647  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 739 aa  1445    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102839 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.12 
 
 		 906 aa  172  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 942 aa  167  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  23.74 
 
 		 595 aa  114  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  25.27 
 
 		 663 aa  105  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  25.12 
 
 		 485 aa  104  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  24.1 
 
 		 457 aa  100  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2276  hypothetical protein  25.89 
 
 		 735 aa  95.1  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  23.88 
 
 		 488 aa  92  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  23.75 
 
 		 490 aa  90.5  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  22.65 
 
 		 490 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  23.45 
 
 		 467 aa  89  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  22.63 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3444  hypothetical protein  25.72 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166801  normal  0.529515 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1691  hypothetical protein  21.89 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1692  hypothetical protein  23.34 
 
 		 392 aa  56.2  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1063  hypothetical protein  20.1 
 
 		 640 aa  50.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000914446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3059  hypothetical protein  23.91 
 
 		 386 aa  49.3  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  24.05 
 
 		 687 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  31.19 
 
 		 745 aa  48.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2674  hypothetical protein  24.52 
 
 		 412 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0271  hypothetical protein  25.16 
 
 		 635 aa  45.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4639  hypothetical protein  21.23 
 
 		 536 aa  43.9  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>