18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1691 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1691  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  850    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1692  hypothetical protein  48.01 
 
 
392 aa  389  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  23.1 
 
 
490 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  23.4 
 
 
488 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  22.17 
 
 
442 aa  66.6  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0534  cytochrome c family protein  22.62 
 
 
324 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2674  hypothetical protein  25.22 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  24.94 
 
 
595 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  22.36 
 
 
490 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6647  Tetratricopeptide TPR_4  22.8 
 
 
739 aa  53.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2937  cytochrome c family protein  20.07 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0447  hypothetical protein  21.38 
 
 
323 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.282921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4120  hypothetical protein  20.45 
 
 
324 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.609345 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1172  cytochrome c family protein  19.64 
 
 
320 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00131961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1201  hypothetical protein  19.87 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  20.55 
 
 
485 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0999  hypothetical protein  20.6 
 
 
368 aa  47.4  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1311  hypothetical protein  19.75 
 
 
374 aa  44.3  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0023679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>