25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2801 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  100 
 
 		 488 aa  1023    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  74.54 
 
 		 490 aa  796    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  61.2 
 
 		 485 aa  651    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  62.68 
 
 		 490 aa  668    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  34.95 
 
 		 467 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  32.3 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  32.17 
 
 		 442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  25.64 
 
 		 595 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 942 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4639  hypothetical protein  27.47 
 
 		 536 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  25.4 
 
 		 663 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.14 
 
 		 906 aa  96.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3444  hypothetical protein  29.19 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166801  normal  0.529515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2276  hypothetical protein  25.32 
 
 		 735 aa  87  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6647  Tetratricopeptide TPR_4  25.35 
 
 		 739 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0271  hypothetical protein  25.21 
 
 		 635 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1691  hypothetical protein  23.4 
 
 		 406 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1063  hypothetical protein  23.04 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000914446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  24.15 
 
 		 687 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1692  hypothetical protein  24.38 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0069  hypothetical protein  24.69 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1880  hypothetical protein  22.6 
 
 		 934 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2450  hypothetical protein  30.23 
 
 		 408 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2674  hypothetical protein  21.18 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0894  cytochrome c-554 precursor  29.81 
 
 		 240 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>