24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0867 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  62.08 
 
 
490 aa  659    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  61.43 
 
 
490 aa  654    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  63.74 
 
 
488 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  100 
 
 
485 aa  1019    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  35.31 
 
 
467 aa  249  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  31.86 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  29.91 
 
 
442 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  22.5 
 
 
595 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4639  hypothetical protein  26.46 
 
 
536 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6647  Tetratricopeptide TPR_4  25.6 
 
 
739 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102839 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  24.85 
 
 
663 aa  91.3  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.49 
 
 
906 aa  84  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0271  hypothetical protein  25.2 
 
 
635 aa  83.6  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3444  hypothetical protein  25.99 
 
 
459 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166801  normal  0.529515 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1063  hypothetical protein  24.26 
 
 
640 aa  81.3  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000914446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2276  hypothetical protein  24.44 
 
 
735 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  27.68 
 
 
687 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1880  hypothetical protein  23.23 
 
 
934 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2674  hypothetical protein  25 
 
 
412 aa  60.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0069  hypothetical protein  24.07 
 
 
434 aa  60.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 
942 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1692  hypothetical protein  24.16 
 
 
392 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1762  hypothetical protein  23.31 
 
 
305 aa  47.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1691  hypothetical protein  20.55 
 
 
406 aa  47.8  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>