18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0271 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0271  hypothetical protein  100 
 
 		 635 aa  1316    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1063  hypothetical protein  42.69 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000914446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4639  hypothetical protein  30.8 
 
 		 536 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1880  hypothetical protein  28.16 
 
 		 934 aa  173  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  25.67 
 
 		 490 aa  94.7  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  28.29 
 
 		 467 aa  93.2  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  25.76 
 
 		 488 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  26.14 
 
 		 490 aa  92.8  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  23.38 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  25.46 
 
 		 485 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  23.68 
 
 		 442 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3444  hypothetical protein  24.7 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166801  normal  0.529515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2276  hypothetical protein  25.84 
 
 		 735 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.7 
 
 		 906 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2674  hypothetical protein  24.36 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3059  hypothetical protein  35.71 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6647  Tetratricopeptide TPR_4  25.16 
 
 		 739 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0069  hypothetical protein  24.36 
 
 		 434 aa  44.3  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>