15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1880 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1880  hypothetical protein  100 
 
 		 934 aa  1922    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0271  hypothetical protein  28.32 
 
 		 635 aa  161  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1063  hypothetical protein  27.17 
 
 		 640 aa  154  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000914446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4639  hypothetical protein  24.95 
 
 		 536 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  28.08 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  25.73 
 
 		 490 aa  63.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  23.72 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  23.57 
 
 		 663 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  25 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  23.23 
 
 		 485 aa  60.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  25.31 
 
 		 595 aa  60.1  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  22.38 
 
 		 488 aa  55.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2276  hypothetical protein  24.74 
 
 		 735 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.75 
 
 		 906 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2674  hypothetical protein  24.52 
 
 		 412 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>