16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2276 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2276  hypothetical protein  100 
 
 		 735 aa  1504    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  41.04 
 
 		 663 aa  490  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 906 aa  189  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 942 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  25.93 
 
 		 595 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  24.25 
 
 		 457 aa  110  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  24.28 
 
 		 467 aa  91.3  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3444  hypothetical protein  28.2 
 
 		 459 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166801  normal  0.529515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6647  Tetratricopeptide TPR_4  26.15 
 
 		 739 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  25.11 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  23.93 
 
 		 490 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  23.76 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  21.93 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  24.44 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0271  hypothetical protein  24.62 
 
 		 635 aa  51.6  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1880  hypothetical protein  24.74 
 
 		 934 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>