294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1062 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  512  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  57.74 
 
 
293 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  55.51 
 
 
261 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  45.04 
 
 
240 aa  231  8.000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  42.8 
 
 
237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  40.66 
 
 
242 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  43.46 
 
 
243 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  38.14 
 
 
236 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  38.59 
 
 
241 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  37.97 
 
 
242 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  37.08 
 
 
247 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  39.33 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  38.08 
 
 
244 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  39 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  37.6 
 
 
256 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  39 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  36.55 
 
 
251 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  39.09 
 
 
242 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  36.82 
 
 
244 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  35.74 
 
 
245 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  35.74 
 
 
245 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  38.46 
 
 
247 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  38.25 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  38.17 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  36.69 
 
 
254 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  36.93 
 
 
246 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  35.95 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  35.95 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  35.95 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  33.05 
 
 
242 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  33.03 
 
 
247 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  36.75 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  36.1 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  36.51 
 
 
243 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  35.77 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  35.77 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  35.19 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  34.87 
 
 
241 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  35.83 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  31.88 
 
 
281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  33.47 
 
 
279 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  36.13 
 
 
254 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0315  protein of unknown function DUF72  32.96 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  33.76 
 
 
218 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0131  hypothetical protein  31.4 
 
 
240 aa  124  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  31.69 
 
 
246 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  35.1 
 
 
387 aa  123  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  33.48 
 
 
261 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  34.08 
 
 
244 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  29.03 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  31.49 
 
 
271 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  33.63 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0235  hypothetical protein  32.95 
 
 
271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2992  hypothetical protein  34.7 
 
 
272 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0078078  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  33.18 
 
 
244 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  34.66 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  33.9 
 
 
286 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  31.87 
 
 
256 aa  115  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1134  hypothetical protein  28.46 
 
 
231 aa  115  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.324615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  31.08 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  32.38 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  33.08 
 
 
280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  28.84 
 
 
303 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  31.71 
 
 
276 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  34.6 
 
 
242 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  33.63 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1082  protein of unknown function DUF72  29.22 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00357332  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  30.63 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  31.84 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2472  hypothetical protein  32.23 
 
 
230 aa  109  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0205  hypothetical protein  31.28 
 
 
229 aa  109  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.967531 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0720  hypothetical protein  31.87 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  40 
 
 
166 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  27.88 
 
 
249 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  28.57 
 
 
305 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  29.51 
 
 
251 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  32.26 
 
 
241 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  27.14 
 
 
318 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  30.6 
 
 
313 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  29.21 
 
 
312 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  28.22 
 
 
350 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  28.57 
 
 
277 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2017  hypothetical protein  30.33 
 
 
231 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  26.6 
 
 
340 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  29.74 
 
 
312 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0421  protein of unknown function DUF72  31.08 
 
 
267 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.738835  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  32.23 
 
 
293 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  28.04 
 
 
282 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  28.92 
 
 
305 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  30.42 
 
 
261 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0778  hypothetical protein  30.52 
 
 
250 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  30.42 
 
 
261 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  26.79 
 
 
301 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0418  hypothetical protein  31.42 
 
 
217 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.443516  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  30.83 
 
 
303 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  30.83 
 
 
303 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  30.83 
 
 
303 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  31.06 
 
 
321 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  32.46 
 
 
249 aa  99.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>