More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0978 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 345 aa  707    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  32.95 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  39.13 
 
 		 370 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  29.14 
 
 		 357 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  38.99 
 
 		 374 aa  136  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  31.18 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  38.33 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  40.58 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  33.04 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  35.1 
 
 		 380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  32.54 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  36.36 
 
 		 377 aa  125  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  35.16 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  34.63 
 
 		 389 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  38.38 
 
 		 370 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 392 aa  122  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  40.21 
 
 		 586 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  37.5 
 
 		 576 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  37.65 
 
 		 556 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  36.36 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  38.69 
 
 		 556 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  36.17 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  34.29 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  35.14 
 
 		 557 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  35.14 
 
 		 557 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  33.88 
 
 		 491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  31.94 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 558 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  35.79 
 
 		 558 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  31.92 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  32.5 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  33.33 
 
 		 726 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  34.38 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  32.65 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  35.14 
 
 		 557 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  31.31 
 
 		 400 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  35.14 
 
 		 557 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  35.14 
 
 		 557 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  35.92 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  35.14 
 
 		 557 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  29.33 
 
 		 398 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  36.82 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  34.25 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  32.63 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  32.19 
 
 		 344 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  35.64 
 
 		 382 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  35.1 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  31.54 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  34.78 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  30.61 
 
 		 482 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  30.67 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  26.05 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  32.81 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  32.16 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  36.53 
 
 		 560 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  37.21 
 
 		 465 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  36.41 
 
 		 408 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  31.34 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 		 572 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  30.91 
 
 		 572 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  32.54 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  35.35 
 
 		 409 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  35.98 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  30.12 
 
 		 367 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  31.75 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  29.62 
 
 		 569 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  40.16 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  31.37 
 
 		 577 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  35.42 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  29.73 
 
 		 578 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  38.1 
 
 		 556 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  33.85 
 
 		 645 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  32.08 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  30.1 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  31.22 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  36.67 
 
 		 642 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  30.49 
 
 		 568 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 559 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  33.67 
 
 		 576 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  36.11 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  34.83 
 
 		 403 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  34.83 
 
 		 403 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  34.83 
 
 		 403 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  37.29 
 
 		 565 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 559 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  31.2 
 
 		 559 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3417  signal transduction histidine kinase, LytS  34.57 
 
 		 559 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.076956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 559 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 559 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 559 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  31.2 
 
 		 565 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  31.2 
 
 		 565 aa  106  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  31.2 
 
 		 565 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 1018 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  31.22 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  28.68 
 
 		 565 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>