More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0725 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0725  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
495 aa  982    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0064  PAS sensor protein  31.45 
 
 
456 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106866  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0580  hypothetical protein  27.17 
 
 
407 aa  141  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.376144  hitchhiker  0.000000596414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3403  PAS sensor protein  39.89 
 
 
189 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3590  glutathionylspermidine synthase  33.33 
 
 
423 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  0.320323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0130  PAS sensor protein  39.35 
 
 
451 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 
174 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2378  transcriptional regulator  36.31 
 
 
174 aa  120  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.16 
 
 
519 aa  119  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4792  putative PAS/PAC sensor protein  36.93 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1312  putative PAS/PAC sensor protein  38.07 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  0.171791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6942  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.24 
 
 
566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0368  PAS sensor protein  35.54 
 
 
168 aa  118  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  46.46 
 
 
565 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3595  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.92 
 
 
515 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1294  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.45 
 
 
575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00873235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3406  PAS  37.75 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387271  normal  0.671486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4009  PAS  34.88 
 
 
172 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.46 
 
 
532 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.67 
 
 
519 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.69 
 
 
550 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2014  aerotaxis receptor  37.75 
 
 
521 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05500  PAS domain S-box  43.36 
 
 
194 aa  114  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.98 
 
 
543 aa  113  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112151 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2125  methyl-accepting chemotaxis protein  41.5 
 
 
514 aa  113  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0264  methyl-accepting chemotaxis protein  42.75 
 
 
580 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2473  methyl-accepting chemotaxis protein  42.75 
 
 
580 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2685  methyl-accepting chemotaxis protein  42.75 
 
 
580 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2390  methyl-accepting chemotaxis protein  42.75 
 
 
580 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.790589  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1233  methyl-accepting chemotaxis protein  34.59 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0927  methyl-accepting chemotaxis protein  42.75 
 
 
623 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.5 
 
 
519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0760  aerotaxis sensor receptor  42.75 
 
 
583 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0158  PAS sensor protein  34.46 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00559927  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0618  methyl-accepting chemotaxis protein  42.75 
 
 
583 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2452  PAS  39.07 
 
 
518 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2920  aerotaxis sensor receptor  42.64 
 
 
549 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3464  transcriptional regulator  33.52 
 
 
174 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0749  aerotaxis sensor receptor  42.75 
 
 
669 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1223  signal-transduction sensor protein  33.33 
 
 
189 aa  110  7.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.658782  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.16 
 
 
521 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 
521 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00326538  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0389  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.34 
 
 
419 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.52 
 
 
556 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2372  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.32 
 
 
579 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1684  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.1 
 
 
525 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3770  aerotaxis receptor Aer  40.34 
 
 
521 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2111  aerotaxis receptor Aer-2  38.52 
 
 
521 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0317394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44300  aerotaxis receptor Aer  38.66 
 
 
521 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 
521 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 
521 aa  106  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.258308  normal  0.504821 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2118  methyl-accepting chemotaxis protein  46.49 
 
 
514 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0801  methyl-accepting chemotaxis protein  46.49 
 
 
514 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1814  aerotaxis receptor  46.49 
 
 
514 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4658  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  40.17 
 
 
529 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1987  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with PAS/Pac sensor  36.64 
 
 
518 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.185607  normal  0.0170041 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0387  aerotaxis sensor receptor  46.49 
 
 
514 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0904499  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0485  aerotaxis sensor receptor  46.49 
 
 
514 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537813  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
521 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1125  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.38 
 
 
532 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.34 
 
 
521 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664053  normal  0.0821551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.7 
 
 
521 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.24 
 
 
566 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
182 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3294  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
524 aa  104  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4977  putative PAS/PAC sensor protein  37.75 
 
 
177 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0729  PAS  40.17 
 
 
945 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0635035  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2936  putative PAS/PAC sensor protein  31.87 
 
 
201 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178135  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0583  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.5 
 
 
524 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.344402 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1962  methyl-accepting chemotaxis protein  31.74 
 
 
166 aa  104  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3447  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.5 
 
 
524 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.5 
 
 
521 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.378373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.34 
 
 
534 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4521  aerotaxis receptor, putative  39.34 
 
 
521 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  40.83 
 
 
1214 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1363  PAS  37.93 
 
 
544 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1071  putative PAS/PAC sensor protein  37.25 
 
 
178 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.5 
 
 
526 aa  103  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1487  methyl-accepting chemotaxis protein  47.27 
 
 
494 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3270  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 
532 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.415489  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1860  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.26 
 
 
524 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1833  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  38.52 
 
 
521 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.884809  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.43 
 
 
523 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416992  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.52 
 
 
521 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.629648  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  36.43 
 
 
516 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.1353  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1648  aerotaxis receptor  37.7 
 
 
521 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3735  PAS  36.89 
 
 
521 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.23 
 
 
506 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.538358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2257  aerotaxis receptor Aer-1  36.72 
 
 
521 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215452  normal  0.0215353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0584  methyl-accepting chemotaxis protein  35.83 
 
 
524 aa  101  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0995  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.07 
 
 
517 aa  101  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.6 
 
 
598 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0582  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.5 
 
 
524 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.68 
 
 
520 aa  100  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0262  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.87 
 
 
524 aa  100  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4975  putative PAS/PAC sensor protein  35.92 
 
 
178 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161434  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.18 
 
 
521 aa  100  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0413099 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1224  aerotaxis sensor receptor transmembrane protein  41.03 
 
 
514 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229455  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3403  aerotaxis receptor  40.8 
 
 
506 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>