More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0619 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
273 aa  549  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 
228 aa  89  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  33.56 
 
 
217 aa  89  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  39.35 
 
 
243 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  33.52 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  35.57 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  33.56 
 
 
217 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  32.89 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  36.27 
 
 
214 aa  86.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  38.22 
 
 
240 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  32.89 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  27.24 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  30.2 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.44 
 
 
278 aa  79  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  31.54 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  31.54 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  31.54 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  31.54 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  31.54 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 
228 aa  77  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  28.77 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  34.84 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  27.31 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  25.83 
 
 
260 aa  72  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  26.19 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  31.33 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  33.55 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  30.64 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  34.55 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  31.38 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  32.52 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1077  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1748  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 
223 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  36.77 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
281 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  31.13 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  31.13 
 
 
281 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.48 
 
 
207 aa  63.5  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  31.45 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
304 aa  62.4  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  31.85 
 
 
285 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  32.05 
 
 
285 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  32.94 
 
 
290 aa  62.4  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  32.05 
 
 
285 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  34.16 
 
 
232 aa  62.4  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  28.43 
 
 
232 aa  62  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  29.86 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 
230 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  28.7 
 
 
212 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.78 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 
208 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 
213 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  31.06 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  31.03 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  31.03 
 
 
215 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.43 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  30.57 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  28.43 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  31.03 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  31.03 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  31.03 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  29.94 
 
 
281 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 
322 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>