More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0292 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0292  cell cycle protein  100 
 
 		 413 aa  823    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  36.6 
 
 		 421 aa  217  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  39.06 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  39.06 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 369 aa  208  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  36.48 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  38.89 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  35.98 
 
 		 367 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  37.99 
 
 		 378 aa  200  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  37.08 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  41.18 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  39.74 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  37.62 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  33.17 
 
 		 365 aa  193  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.25 
 
 		 379 aa  193  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  36.69 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  36.83 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  34.71 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  38.08 
 
 		 387 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 366 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  33.12 
 
 		 451 aa  187  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  33.42 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.27 
 
 		 366 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  33.77 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  35.05 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  35.12 
 
 		 378 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  35.21 
 
 		 372 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  33.5 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  33.09 
 
 		 372 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  37.16 
 
 		 377 aa  179  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  35.73 
 
 		 423 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  37.54 
 
 		 367 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  34.96 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  35.28 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  35.1 
 
 		 379 aa  177  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  34.97 
 
 		 368 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  34.89 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  34.41 
 
 		 509 aa  176  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  32.04 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  32.92 
 
 		 371 aa  176  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  36.2 
 
 		 368 aa  176  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  35.94 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  36.5 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  35.17 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  35.58 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  31.74 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  34.67 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  34.71 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  35.52 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  35.91 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  33.6 
 
 		 374 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  37.38 
 
 		 366 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  34.64 
 
 		 367 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  33.02 
 
 		 407 aa  172  9e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  36.22 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  37.12 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  34.64 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  34.64 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  31.36 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  33.42 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  33.42 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  33.42 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  36.01 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  33 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  34.46 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  33.08 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  31.59 
 
 		 374 aa  171  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  34.44 
 
 		 370 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  35.58 
 
 		 368 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  35.37 
 
 		 373 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  34.9 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  32.29 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  34.17 
 
 		 370 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  34.17 
 
 		 370 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  34.17 
 
 		 370 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  35.16 
 
 		 366 aa  170  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  33.42 
 
 		 384 aa  170  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  35.67 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0236  cell wall shape-determining protein  37.46 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  33.06 
 
 		 368 aa  169  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  34.58 
 
 		 422 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  33.88 
 
 		 370 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  33.88 
 
 		 370 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  34.5 
 
 		 369 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  33.88 
 
 		 370 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  33.88 
 
 		 370 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  33.88 
 
 		 370 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  33.88 
 
 		 370 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  33.79 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2503  cell cycle protein  30.98 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000231774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  33.88 
 
 		 370 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1100  stage V sporulation protein E  32.38 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  33.89 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  33.89 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  33.89 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  33.89 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  33.89 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>