More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3503 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
466 aa  961    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  75.32 
 
 
466 aa  746    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  70.58 
 
 
464 aa  683    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  63.2 
 
 
479 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  63.33 
 
 
473 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  64.38 
 
 
464 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  64.22 
 
 
471 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  64.44 
 
 
472 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  66.52 
 
 
463 aa  597  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  63.11 
 
 
469 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  63.78 
 
 
471 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  61.89 
 
 
464 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  61.24 
 
 
473 aa  587  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  65.41 
 
 
462 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  64.16 
 
 
462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  54.74 
 
 
482 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  55.72 
 
 
499 aa  529  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  41.14 
 
 
454 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 
446 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 
442 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 
447 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 
442 aa  265  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  35.1 
 
 
452 aa  260  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 
445 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 
425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.35 
 
 
426 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 
426 aa  179  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.13 
 
 
426 aa  179  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.13 
 
 
426 aa  179  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.13 
 
 
426 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 
426 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.13 
 
 
426 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.13 
 
 
426 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 
435 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 
434 aa  176  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.45 
 
 
426 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 
428 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
432 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
427 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 
424 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
425 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
424 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
425 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
425 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 
444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  31.67 
 
 
430 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 
424 aa  166  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  31.55 
 
 
424 aa  166  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  31.52 
 
 
428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 
444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 
430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  31.16 
 
 
449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 
444 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 
437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 
425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  29.05 
 
 
430 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 
428 aa  163  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
428 aa  162  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
428 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 
430 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
428 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
428 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  30.97 
 
 
428 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
428 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
428 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
428 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 
425 aa  161  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 
435 aa  160  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 
428 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
425 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 
427 aa  159  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 
424 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 
427 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 
436 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
435 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
435 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
424 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
435 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
424 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 
433 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
440 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
435 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  29.93 
 
 
427 aa  156  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
433 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
433 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  30.79 
 
 
424 aa  156  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
435 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 
435 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
427 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
435 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
433 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  29.95 
 
 
465 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
440 aa  154  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>