More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2762 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2762  alanine racemase  100 
 
 		 356 aa  721    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3936  LacI family transcription regulator  34.78 
 
 		 357 aa  179  9e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125487  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2939  alanine racemase  33.53 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0302  sugar-binding protein, putative  31.55 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0278  putative sugar-binding protein  31.55 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.396781  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5490  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 		 337 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932078  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1730  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.7 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0821566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  26.65 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6046  LacI family transcription regulator  33.97 
 
 		 338 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234203  hitchhiker  0.00000507453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2099  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.116566 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3460  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.42 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.105579  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5384  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2338  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 347 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3787  transcriptional regulator, LacI family  30.72 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6569  transcriptional regulator, LacI family  33.76 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0434919  normal  0.571175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1434  transcriptional regulator, LacI family  30.51 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  28.9 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0291  alanine racemase  32.34 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.910588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  28.96 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0737  transcriptional regulator RafR, putative  33.55 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2398  transcriptional regulator LacI family  29.18 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3813  alanine racemase  32.25 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0467  putative raffinose repressor  33.23 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1871  raffinose repressor, putative  33.87 
 
 		 336 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0713  putative raffinose repressor  33.23 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1009  putative raffinose repressor  33.23 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1982  putative raffinose repressor  33.23 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0824  transcriptional regulator RafR, putative  33.23 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2103  LacI family regulatory protein  33.23 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3492  transcriptional regulator, LacI family  30.24 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3699  LacI family transcription regulator  31.96 
 
 		 344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0783  transcriptional regulator repressor  30.06 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  30.12 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.01 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2393  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  32.05 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  7.93999e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2491  LacI family transcription regulator  32.05 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.934393  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4172  LacI family transcription regulator  31.96 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0578357  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5998  transcriptional regulator, LacI family  31.19 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1653  HTH-type transcriptional regulator  30.33 
 
 		 354 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117705  hitchhiker  0.0000123229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6733  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 354 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7146  transcriptional regulator, LacI family  30.87 
 
 		 439 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0386  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 341 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0354  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 342 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.152547 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3246  LacI family transcription regulator  33.12 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.759172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4919  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.59 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.35548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  30.29 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4095  LacI family transcription regulator  32.8 
 
 		 342 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4271  LacI family transcription regulator  32.8 
 
 		 342 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6153  transcriptional regulator, LacI family  33.65 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.312144  hitchhiker  0.000597888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  28.62 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  28.06 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  28.23 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0224  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.96 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  30.84 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  31.67 
 
 		 351 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  27.43 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 		 349 aa  135  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  30.54 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1282  LacI family transcription regulator  29.55 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000725073  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1945  LacI family transcription regulator  29.88 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  28.36 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  27.41 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  31.55 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  31.15 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  29.28 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  31.53 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  27.57 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.08 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59427  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  31.67 
 
 		 346 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  26.25 
 
 		 332 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.54 
 
 		 339 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  28.99 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  29.24 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5394  transcriptional regulator LacI family  29.9 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00772538  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  31.43 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  26.2 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  30.06 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  26.19 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  30.15 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  31.09 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  31.97 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  26.05 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  29.08 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2074  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2854  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  25.3 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.71 
 
 		 336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  29.94 
 
 		 339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  30.59 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  30.34 
 
 		 359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3308  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 346 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.608255  normal  0.781204 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  27.01 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.91 
 
 		 335 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  27.95 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  27.67 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.7 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>