More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0604 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  89.93 
 
 
596 aa  1044    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  58.85 
 
 
594 aa  648    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0604  chloride channel core  100 
 
 
597 aa  1182    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  61.54 
 
 
596 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  61.2 
 
 
596 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5810  Chloride channel core  60.17 
 
 
606 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3994  chloride channel core  57.38 
 
 
643 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0550665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5245  chloride channel core  58.11 
 
 
606 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  decreased coverage  0.00444672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  55.03 
 
 
614 aa  598  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2779  chloride channel core  55.37 
 
 
649 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.674097  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  55.57 
 
 
614 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  51.13 
 
 
603 aa  529  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1483  Chloride channel core  50.51 
 
 
628 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1634  Chloride channel core  52.06 
 
 
601 aa  502  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0200608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  47.22 
 
 
595 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  47.36 
 
 
606 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  47.35 
 
 
635 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  43.42 
 
 
602 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4075  chloride channel core  46.43 
 
 
587 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.480414  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  42.78 
 
 
604 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3739  chloride channel, core  46.34 
 
 
582 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2309  Chloride channel core  45.18 
 
 
590 aa  385  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0529111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4838  chloride channel, core  42.91 
 
 
584 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0107  CBS  43.62 
 
 
579 aa  350  5e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.52 
 
 
582 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.69 
 
 
615 aa  177  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.71 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.71 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.71 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.71 
 
 
636 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.07 
 
 
613 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.23 
 
 
598 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.12 
 
 
628 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.83 
 
 
591 aa  161  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  29.41 
 
 
470 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.63 
 
 
589 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  27.45 
 
 
577 aa  158  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.85 
 
 
589 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.85 
 
 
589 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.9 
 
 
591 aa  154  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.06 
 
 
587 aa  154  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  25.95 
 
 
614 aa  154  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.73 
 
 
589 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.17 
 
 
593 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.95 
 
 
593 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  25.96 
 
 
669 aa  150  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.54 
 
 
591 aa  147  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.52 
 
 
577 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  27.64 
 
 
590 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.62 
 
 
585 aa  137  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  24.45 
 
 
627 aa  137  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  25.38 
 
 
608 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  28.08 
 
 
543 aa  136  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.42 
 
 
565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  32.11 
 
 
464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  32.11 
 
 
464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.05 
 
 
580 aa  134  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  26.16 
 
 
624 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  27.53 
 
 
597 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  26.39 
 
 
593 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  26.07 
 
 
640 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.27 
 
 
606 aa  127  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.69 
 
 
594 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  24.63 
 
 
617 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  26.65 
 
 
579 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  26.35 
 
 
598 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  23.08 
 
 
631 aa  124  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.08 
 
 
598 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  27.67 
 
 
564 aa  121  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.72 
 
 
575 aa  120  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  26.75 
 
 
569 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.78 
 
 
620 aa  117  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  26.68 
 
 
562 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  32.73 
 
 
527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  27.65 
 
 
626 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  25.39 
 
 
586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  24.67 
 
 
628 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.28 
 
 
426 aa  115  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.43 
 
 
426 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  24.92 
 
 
613 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  28.94 
 
 
402 aa  114  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.61 
 
 
414 aa  114  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.08 
 
 
591 aa  113  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.29 
 
 
560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.5 
 
 
584 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  25.95 
 
 
595 aa  111  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  28.28 
 
 
585 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  25.38 
 
 
579 aa  108  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  23.16 
 
 
627 aa  107  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  23.33 
 
 
602 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.67 
 
 
754 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  28 
 
 
625 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  27.66 
 
 
575 aa  103  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  25.91 
 
 
586 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  27.32 
 
 
457 aa  103  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  25.33 
 
 
519 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43785  predicted protein  27.92 
 
 
588 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000378872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  25.06 
 
 
600 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  23.14 
 
 
603 aa  101  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>