241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_25116 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  100 
 
 
323 aa  627  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  46.21 
 
 
315 aa  216  4e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  41.37 
 
 
261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  40.56 
 
 
301 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  39.7 
 
 
282 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  40.43 
 
 
275 aa  172  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  41.67 
 
 
274 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  41.3 
 
 
274 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  36.86 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  39.06 
 
 
269 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  42.35 
 
 
274 aa  162  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  41.13 
 
 
284 aa  162  7e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  37.41 
 
 
270 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  40 
 
 
271 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  37.83 
 
 
278 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  36.92 
 
 
310 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  35.4 
 
 
301 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  41.57 
 
 
280 aa  155  6e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  37.6 
 
 
283 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  38.63 
 
 
274 aa  150  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  32.27 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  39.01 
 
 
290 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  36.68 
 
 
271 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  36.86 
 
 
271 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  36.86 
 
 
271 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  36.86 
 
 
271 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  36.86 
 
 
271 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  36.86 
 
 
271 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  38.77 
 
 
292 aa  142  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  44.5 
 
 
269 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  36.47 
 
 
271 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  36.47 
 
 
271 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  37.83 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  34.27 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  42.4 
 
 
425 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  36.29 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  36.29 
 
 
263 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  35.91 
 
 
271 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  38.85 
 
 
289 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  36.92 
 
 
316 aa  139  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  36.88 
 
 
287 aa  138  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  36.72 
 
 
269 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  36.15 
 
 
279 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  36.68 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  37.24 
 
 
251 aa  135  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  38.22 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  33.69 
 
 
296 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  36.14 
 
 
290 aa  133  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  37 
 
 
265 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  34.43 
 
 
303 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  34.43 
 
 
303 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  34.42 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  35.93 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  31.18 
 
 
289 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  35.88 
 
 
310 aa  129  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  30.85 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  41.18 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  40.84 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  34.23 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  39.22 
 
 
280 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  30.71 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  35.38 
 
 
281 aa  126  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  32.12 
 
 
286 aa  125  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  32.25 
 
 
285 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  32.25 
 
 
285 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  35.68 
 
 
265 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  32 
 
 
286 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  32.25 
 
 
285 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  35.46 
 
 
282 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  33.46 
 
 
483 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  34.77 
 
 
483 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  35.77 
 
 
274 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  31.07 
 
 
286 aa  122  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  32.48 
 
 
285 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  34.87 
 
 
269 aa  122  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 
270 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  33.46 
 
 
483 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  34.35 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  33.09 
 
 
295 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  33.7 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  30.43 
 
 
285 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  33.46 
 
 
382 aa  119  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2657  formate and nitrite transporters  33.09 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00842969  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  31.82 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  38.35 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  34.23 
 
 
270 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47526  Probable formate transporter 1 (Formate channel 1)  29.15 
 
 
444 aa  117  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  37.33 
 
 
266 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  34.93 
 
 
558 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  32.69 
 
 
282 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  30.8 
 
 
286 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  34.29 
 
 
252 aa  116  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  37.2 
 
 
285 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  32.94 
 
 
259 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  32.94 
 
 
259 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  32.94 
 
 
259 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  32.94 
 
 
259 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  31.27 
 
 
285 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  33.33 
 
 
273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>