More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3139 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3139  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 362 aa  731    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4035  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  82.04 
 
 		 364 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  62.95 
 
 		 369 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4938  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  63.1 
 
 		 366 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5317  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  62.78 
 
 		 367 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4416  metal-dependent phosphohydrolase  61.52 
 
 		 368 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4706  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  60.91 
 
 		 368 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1329  metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  52.86 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5466  hypothetical protein  37.09 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3656  metal dependent phophohydrolase  36.63 
 
 		 347 aa  209  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3949  metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0476143  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3546  hypothetical protein  38.94 
 
 		 350 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0917  metal dependent phosphohydrolase  38.78 
 
 		 353 aa  206  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  50.7 
 
 		 358 aa  205  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  36.34 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5693  metal dependent phosphohydrolase  52.41 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  49.77 
 
 		 388 aa  185  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  44.04 
 
 		 357 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0366  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.26 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  47.89 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4291  metal dependent phosphohydrolase  47.42 
 
 		 385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0506003 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  34.33 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  39.29 
 
 		 409 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  41.25 
 
 		 431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  39.68 
 
 		 419 aa  125  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  36.75 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  36.9 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  38.36 
 
 		 410 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  35.16 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  37.11 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 		 345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  37.87 
 
 		 419 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  36.48 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  39.87 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  37.06 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 		 496 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  36.47 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  36.48 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  38.99 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 		 439 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  36.47 
 
 		 413 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 		 1073 aa  112  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  37.11 
 
 		 401 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  37.21 
 
 		 360 aa  112  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  37.74 
 
 		 414 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  36.6 
 
 		 1333 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03429  two-component system response regulator (hybrid family) protein  27.15 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00476  two-component system regulatory protein with HD-GYP domain  37.57 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 		 713 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  36.09 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  36.25 
 
 		 509 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  41.38 
 
 		 771 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  37.28 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  36.48 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.88 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  35.43 
 
 		 736 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2178  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 		 335 aa  106  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  35.5 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 		 562 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  34.22 
 
 		 836 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.32 
 
 		 841 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 		 698 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 		 487 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2274  metal-dependent phosphohydrolase  37.85 
 
 		 442 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.293482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 574 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  33.89 
 
 		 199 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  35.82 
 
 		 792 aa  103  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.68 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 		 338 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3313  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.42 
 
 		 343 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  39.74 
 
 		 420 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2661  metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 		 469 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.69 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 		 1237 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 		 247 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  31.42 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>