More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2178 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  91.6 
 
 		 250 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  76.4 
 
 		 250 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  74.3 
 
 		 249 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  72 
 
 		 250 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  71.6 
 
 		 250 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  69.32 
 
 		 251 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  57.87 
 
 		 254 aa  291  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  57.87 
 
 		 254 aa  291  8e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  58.3 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  52.94 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  54 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  55.87 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  55.47 
 
 		 256 aa  275  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  55.24 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  50.2 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  54.44 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  53.2 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  50.58 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  50.2 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  56.5 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  51.57 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  52.85 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  50.78 
 
 		 258 aa  250  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  49.61 
 
 		 258 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  44.72 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  40.89 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  37.18 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  33.98 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 279 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  30.56 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.47 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  31.42 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  27.94 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  32.67 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.45 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.86 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.86 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  30.84 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.76 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.63 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  40.71 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.45 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3019  putative hydrolase  27.63 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.8 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  30.04 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  28.96 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3745  putative hydrolase  27.63 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  26.94 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.49 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  27.39 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.49 
 
 		 368 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 279 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 297 aa  72  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 265 aa  72  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>