258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1842 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 		 778 aa  1526    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3250  ComEC/Rec2-related protein  61.7 
 
 		 755 aa  822    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2810  ComEC/Rec2-related protein  63.23 
 
 		 764 aa  832    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553334  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2453  ComEC/Rec2-related protein  66.58 
 
 		 774 aa  881    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869804  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2840  ComEC/Rec2-related protein  63.61 
 
 		 764 aa  838    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.431764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1711  ComEC/Rec2-related protein  88.18 
 
 		 413 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  63.66 
 
 		 762 aa  847    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  44.87 
 
 		 757 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0648  ComEC/Rec2-related protein  41.05 
 
 		 738 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4682  ComEC/Rec2-related protein  38.58 
 
 		 752 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5147  ComEC/Rec2-related protein  38.88 
 
 		 752 aa  360  6e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1411  ComEC/Rec2-related protein  36.93 
 
 		 792 aa  356  8.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  36.6 
 
 		 718 aa  346  7e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5224  ComEC/Rec2-related protein  39.41 
 
 		 753 aa  333  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1679  ComEC/Rec2-related protein  33.69 
 
 		 779 aa  324  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2021  ComEC/Rec2-related protein  39.82 
 
 		 760 aa  317  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1522  ComEC/Rec2-related protein  39.6 
 
 		 736 aa  317  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302052  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  36.58 
 
 		 672 aa  312  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  37.59 
 
 		 739 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  35.64 
 
 		 671 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  28.4 
 
 		 674 aa  282  1e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  33.02 
 
 		 757 aa  279  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  31.18 
 
 		 858 aa  279  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  37.44 
 
 		 810 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  32.87 
 
 		 799 aa  273  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1644  ComEC/Rec2-related protein  34.27 
 
 		 788 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  34.11 
 
 		 694 aa  271  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  35.85 
 
 		 706 aa  262  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  25.69 
 
 		 720 aa  262  2e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  33.71 
 
 		 684 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  38.34 
 
 		 754 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_004310  BR1145  ComEC/Rec2 family protein, putative  32.3 
 
 		 843 aa  256  9e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  33.94 
 
 		 684 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  36.97 
 
 		 717 aa  249  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  27.68 
 
 		 672 aa  240  8e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2562  hypothetical protein  32.44 
 
 		 1007 aa  239  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  33.52 
 
 		 726 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  34.08 
 
 		 702 aa  219  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  31.61 
 
 		 697 aa  216  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  34.28 
 
 		 719 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  26.37 
 
 		 736 aa  197  6e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3214  ComEC/Rec2-related protein  32.46 
 
 		 714 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2030  ComEC/Rec2-related protein  32.07 
 
 		 760 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  32.52 
 
 		 695 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.53 
 
 		 797 aa  131  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.58 
 
 		 815 aa  126  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.85 
 
 		 771 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.05 
 
 		 811 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.46 
 
 		 798 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.21 
 
 		 784 aa  111  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.14 
 
 		 777 aa  110  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.74 
 
 		 785 aa  108  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.92 
 
 		 808 aa  107  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  29.52 
 
 		 825 aa  107  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.85 
 
 		 818 aa  105  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.02 
 
 		 840 aa  104  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.79 
 
 		 770 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.69 
 
 		 794 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.12 
 
 		 773 aa  97.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.44 
 
 		 841 aa  97.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.36 
 
 		 814 aa  96.3  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.5 
 
 		 822 aa  95.5  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1202  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.67 
 
 		 776 aa  93.6  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.177641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.18 
 
 		 812 aa  92.8  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.25 
 
 		 801 aa  92.4  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.36 
 
 		 766 aa  91.7  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.77 
 
 		 802 aa  91.3  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.81 
 
 		 778 aa  90.5  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.49 
 
 		 761 aa  89  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.13 
 
 		 791 aa  88.2  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.53 
 
 		 747 aa  87.8  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  27.42 
 
 		 593 aa  87.8  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  27.64 
 
 		 846 aa  87.8  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.3 
 
 		 860 aa  85.9  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.87 
 
 		 773 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.13 
 
 		 780 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.01 
 
 		 878 aa  84.7  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.56 
 
 		 860 aa  84.3  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.32 
 
 		 845 aa  84  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.02 
 
 		 800 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.52 
 
 		 773 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.41 
 
 		 840 aa  82  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.75 
 
 		 948 aa  81.6  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1437  ComEC/Rec2-related protein  28.83 
 
 		 750 aa  81.3  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715322 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  24.15 
 
 		 879 aa  81.3  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.13 
 
 		 835 aa  80.9  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1395  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.53 
 
 		 799 aa  80.9  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.751306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  20.8 
 
 		 679 aa  80.1  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1902  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.48 
 
 		 880 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.23 
 
 		 737 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.69 
 
 		 851 aa  79.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  23.78 
 
 		 734 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.27 
 
 		 861 aa  78.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1569  ComEC/Rec2-related protein  26.78 
 
 		 801 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  25.8 
 
 		 689 aa  78.2  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1806  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.83 
 
 		 804 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.61 
 
 		 786 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  22.2 
 
 		 748 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.65 
 
 		 738 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.94 
 
 		 766 aa  76.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>