268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0848 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
689 aa  1383    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  28.32 
 
 
604 aa  120  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.1 
 
 
778 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.78 
 
 
761 aa  108  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.21 
 
 
757 aa  105  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  25 
 
 
755 aa  100  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.16 
 
 
818 aa  100  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  26.05 
 
 
733 aa  95.5  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.5 
 
 
794 aa  94.7  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  24.38 
 
 
720 aa  92.4  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.84 
 
 
797 aa  90.9  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.7 
 
 
791 aa  89.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  24.81 
 
 
734 aa  87.8  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.5 
 
 
752 aa  87.8  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  26.14 
 
 
708 aa  87.4  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  23.76 
 
 
879 aa  87.4  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  28.57 
 
 
511 aa  86.3  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.51 
 
 
841 aa  85.9  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.81 
 
 
770 aa  85.5  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.83 
 
 
786 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.8 
 
 
775 aa  84.3  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  25.46 
 
 
626 aa  83.2  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  24.47 
 
 
679 aa  82.8  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.33 
 
 
835 aa  81.3  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.16 
 
 
780 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.63 
 
 
840 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  27.24 
 
 
747 aa  80.5  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.08 
 
 
773 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.5 
 
 
784 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  26.23 
 
 
672 aa  78.6  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  24.74 
 
 
706 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.58 
 
 
773 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.18 
 
 
837 aa  77.4  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  27 
 
 
593 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  28.16 
 
 
722 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2840  ComEC/Rec2-related protein  26.27 
 
 
764 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.431764 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  27.43 
 
 
738 aa  75.5  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1346  ComEC/Rec2-related protein  26.72 
 
 
759 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.032062  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.57 
 
 
773 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  24.06 
 
 
678 aa  74.7  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  28.93 
 
 
531 aa  74.7  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.64 
 
 
851 aa  73.9  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  27.67 
 
 
724 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  26.02 
 
 
736 aa  73.6  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  24.53 
 
 
717 aa  73.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.74 
 
 
773 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.5 
 
 
822 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  24.84 
 
 
469 aa  72.8  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.77 
 
 
759 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2453  ComEC/Rec2-related protein  27.08 
 
 
774 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869804  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.25 
 
 
770 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.64 
 
 
868 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  26.18 
 
 
503 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  27.96 
 
 
719 aa  72  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2562  hypothetical protein  26.5 
 
 
1007 aa  71.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  26.29 
 
 
734 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1711  hypothetical protein  24 
 
 
737 aa  71.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0805358  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.93 
 
 
811 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  27.13 
 
 
748 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2310  hypothetical protein  23.7 
 
 
793 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  28.05 
 
 
684 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  21.88 
 
 
636 aa  69.3  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.51 
 
 
772 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.51 
 
 
773 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  25.51 
 
 
773 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  22.27 
 
 
531 aa  69.7  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.93 
 
 
773 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.51 
 
 
772 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  22.32 
 
 
674 aa  69.7  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.51 
 
 
654 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  25.46 
 
 
810 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  25.47 
 
 
697 aa  68.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  29.41 
 
 
684 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  27.45 
 
 
762 aa  68.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1145  ComEC/Rec2 family protein, putative  24.93 
 
 
843 aa  68.6  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.34 
 
 
766 aa  68.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  26.83 
 
 
748 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2040  hypothetical protein  22.71 
 
 
763 aa  67.4  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  23.7 
 
 
858 aa  67.4  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  23.51 
 
 
825 aa  67.4  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  25.88 
 
 
754 aa  67.4  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  22.86 
 
 
439 aa  67  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  26.81 
 
 
694 aa  67  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  27.87 
 
 
671 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf372  hypothetical protein  29.17 
 
 
459 aa  65.9  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246539  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  24.93 
 
 
694 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
808 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  29.41 
 
 
798 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.21 
 
 
773 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13038 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  26.97 
 
 
706 aa  65.1  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.85 
 
 
747 aa  65.1  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3250  ComEC/Rec2-related protein  27.35 
 
 
755 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.58 
 
 
789 aa  65.1  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.51 
 
 
812 aa  64.7  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  19.84 
 
 
860 aa  64.7  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.09 
 
 
814 aa  64.3  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  25.33 
 
 
778 aa  64.3  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1437  ComEC/Rec2-related protein  24.04 
 
 
750 aa  64.3  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.715322 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.06 
 
 
734 aa  63.9  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.38 
 
 
809 aa  63.9  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>