297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1346 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1346  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
759 aa  1474    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.032062  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  43.79 
 
 
747 aa  595  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  41.31 
 
 
734 aa  555  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  40.84 
 
 
733 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  38.53 
 
 
755 aa  503  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1497  ComEC/Rec2-related protein  37.88 
 
 
728 aa  436  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.177997  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  37.55 
 
 
722 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.27 
 
 
778 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.57 
 
 
752 aa  128  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.19 
 
 
818 aa  122  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.12 
 
 
786 aa  118  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.05 
 
 
794 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  26.9 
 
 
593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 
757 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  28.79 
 
 
694 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.17 
 
 
797 aa  107  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  25.69 
 
 
879 aa  105  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.29 
 
 
798 aa  104  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  30.5 
 
 
531 aa  103  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30 
 
 
791 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.03 
 
 
761 aa  100  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.6 
 
 
814 aa  99.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.5 
 
 
773 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.76 
 
 
771 aa  99  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.73 
 
 
775 aa  99  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.2 
 
 
780 aa  96.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.23 
 
 
808 aa  96.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.47 
 
 
896 aa  96.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  35.32 
 
 
511 aa  92.8  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  27.13 
 
 
748 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  27.13 
 
 
689 aa  92.8  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.92 
 
 
770 aa  92.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  23.77 
 
 
706 aa  92.4  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  26.91 
 
 
748 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  30.26 
 
 
626 aa  92  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 
789 aa  91.3  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  25.96 
 
 
708 aa  91.3  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.33 
 
 
777 aa  90.5  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.56 
 
 
773 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.12 
 
 
811 aa  89.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  24.84 
 
 
678 aa  89  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.33 
 
 
759 aa  89.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.93 
 
 
773 aa  89  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  27.17 
 
 
769 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  27.4 
 
 
604 aa  88.2  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  28.2 
 
 
773 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  28.81 
 
 
679 aa  86.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.59 
 
 
773 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.68 
 
 
784 aa  84.7  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.83 
 
 
773 aa  84.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  28.31 
 
 
795 aa  84  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  29.58 
 
 
816 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  28.97 
 
 
671 aa  84  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.95 
 
 
654 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  24.8 
 
 
752 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.16 
 
 
790 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.19 
 
 
795 aa  82.4  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
796 aa  82.4  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.49 
 
 
772 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.49 
 
 
773 aa  82  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.49 
 
 
772 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  29.55 
 
 
684 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.56 
 
 
801 aa  80.9  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  27.25 
 
 
798 aa  80.5  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  26.19 
 
 
872 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.54 
 
 
797 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  27.94 
 
 
448 aa  80.5  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  29.57 
 
 
684 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 
841 aa  79.7  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  25.85 
 
 
546 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.34 
 
 
734 aa  77.8  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  26.33 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.79 
 
 
840 aa  77  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  27.66 
 
 
825 aa  75.9  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  26.71 
 
 
717 aa  75.1  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.95 
 
 
860 aa  75.1  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  29.76 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  29.05 
 
 
672 aa  75.1  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00591  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.88 
 
 
776 aa  74.7  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0903265  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1395  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.67 
 
 
799 aa  74.7  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.751306  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1336  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.63 
 
 
765 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62013 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  24.35 
 
 
720 aa  73.6  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.35 
 
 
750 aa  73.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  26.62 
 
 
872 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.53 
 
 
822 aa  73.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  28.14 
 
 
846 aa  72.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  24.5 
 
 
439 aa  72.8  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.52 
 
 
846 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  33.09 
 
 
736 aa  71.6  0.00000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  28.9 
 
 
591 aa  71.2  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  25.67 
 
 
494 aa  71.2  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  31.86 
 
 
636 aa  70.9  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.7 
 
 
770 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.51 
 
 
833 aa  69.7  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  29.37 
 
 
784 aa  69.3  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  26.72 
 
 
706 aa  69.7  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  22.84 
 
 
531 aa  70.1  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  28.42 
 
 
694 aa  69.3  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.97 
 
 
815 aa  69.3  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.8 
 
 
835 aa  69.3  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>