249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1646 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
747 aa  1501    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  57.05 
 
 
755 aa  815    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  54.31 
 
 
734 aa  761    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  57.89 
 
 
733 aa  858    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1346  ComEC/Rec2-related protein  44.28 
 
 
759 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.032062  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  36.57 
 
 
722 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1497  ComEC/Rec2-related protein  36.63 
 
 
728 aa  435  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.177997  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.25 
 
 
752 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.28 
 
 
778 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.89 
 
 
757 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.34 
 
 
818 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.65 
 
 
791 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.45 
 
 
786 aa  111  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.74 
 
 
789 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  29.11 
 
 
593 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.05 
 
 
796 aa  106  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.44 
 
 
794 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  25.61 
 
 
706 aa  101  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  26.35 
 
 
626 aa  101  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  27.11 
 
 
795 aa  98.2  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.38 
 
 
773 aa  96.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.13 
 
 
795 aa  95.5  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  25.36 
 
 
674 aa  94  9e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  29.08 
 
 
694 aa  94  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  23.76 
 
 
604 aa  93.6  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  24.17 
 
 
678 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.19 
 
 
775 aa  90.1  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.54 
 
 
896 aa  89.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  26.21 
 
 
494 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  26.75 
 
 
708 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24 
 
 
761 aa  86.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  24.76 
 
 
546 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.54 
 
 
780 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  26.54 
 
 
672 aa  84.3  0.000000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  27.37 
 
 
531 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.49 
 
 
734 aa  83.2  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.66 
 
 
773 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  24.02 
 
 
679 aa  81.6  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.56 
 
 
797 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  26.73 
 
 
773 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  27.24 
 
 
689 aa  79.3  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.88 
 
 
790 aa  79.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0304  ComEC/Rec2-related protein  22.08 
 
 
358 aa  79  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.95 
 
 
841 aa  78.2  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  25.34 
 
 
531 aa  78.2  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  24.45 
 
 
720 aa  78.2  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.27 
 
 
759 aa  77.4  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.76 
 
 
773 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  27.44 
 
 
684 aa  77.4  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  26.8 
 
 
671 aa  77  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  24.7 
 
 
879 aa  76.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.27 
 
 
772 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.27 
 
 
773 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.61 
 
 
784 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.27 
 
 
772 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.07 
 
 
770 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.27 
 
 
654 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  23.1 
 
 
503 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.3 
 
 
750 aa  75.5  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
797 aa  75.1  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.73 
 
 
773 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  26.9 
 
 
697 aa  75.1  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  30.7 
 
 
672 aa  74.7  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  24.01 
 
 
493 aa  74.7  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.43 
 
 
808 aa  74.3  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  26.2 
 
 
784 aa  72.8  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  27.04 
 
 
684 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  29.08 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  23.95 
 
 
798 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.84 
 
 
773 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  27.85 
 
 
762 aa  72  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.75 
 
 
722 aa  72  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3672  ComEC/Rec2-related protein  25 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
773 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  24.66 
 
 
872 aa  70.1  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.94 
 
 
809 aa  70.5  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  25.95 
 
 
717 aa  70.1  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1336  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.32 
 
 
765 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.82 
 
 
766 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.45 
 
 
837 aa  69.7  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  27.63 
 
 
757 aa  69.7  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  28.36 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.91 
 
 
840 aa  68.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  28.06 
 
 
710 aa  68.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1202  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.87 
 
 
776 aa  68.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.177641 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  26.69 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  26.35 
 
 
769 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  23.06 
 
 
799 aa  68.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  29.47 
 
 
636 aa  67.8  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3214  ComEC/Rec2-related protein  21.83 
 
 
714 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  23.54 
 
 
752 aa  67  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.9 
 
 
770 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  23.46 
 
 
757 aa  66.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2810  ComEC/Rec2-related protein  23.08 
 
 
764 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553334  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  26.88 
 
 
748 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  27.37 
 
 
754 aa  65.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  26.88 
 
 
748 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.5 
 
 
798 aa  65.1  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.97 
 
 
812 aa  65.1  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  26.12 
 
 
872 aa  64.7  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>