262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1551 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  49.59 
 
 
755 aa  677    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
734 aa  1487    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  61.66 
 
 
733 aa  891    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  54.31 
 
 
747 aa  750    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1346  ComEC/Rec2-related protein  41.31 
 
 
759 aa  526  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.032062  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  41.37 
 
 
722 aa  511  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1497  ComEC/Rec2-related protein  39.02 
 
 
728 aa  459  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.177997  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.15 
 
 
752 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.87 
 
 
778 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.99 
 
 
757 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.35 
 
 
796 aa  126  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.12 
 
 
786 aa  126  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.28 
 
 
791 aa  124  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.47 
 
 
795 aa  120  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.3 
 
 
818 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  28.73 
 
 
795 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  28.92 
 
 
593 aa  117  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  28.81 
 
 
626 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.13 
 
 
794 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.69 
 
 
798 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  29.61 
 
 
694 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  27.42 
 
 
679 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 
797 aa  101  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  26.95 
 
 
706 aa  100  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  29.41 
 
 
531 aa  100  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  24.58 
 
 
604 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.25 
 
 
789 aa  98.6  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.8 
 
 
775 aa  97.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  27.22 
 
 
708 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  26.46 
 
 
678 aa  94.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.11 
 
 
896 aa  94.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.32 
 
 
761 aa  94.4  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  26.28 
 
 
493 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  34.33 
 
 
636 aa  90.5  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.93 
 
 
759 aa  90.5  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.16 
 
 
773 aa  89.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  27.27 
 
 
672 aa  87.8  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  26.82 
 
 
494 aa  87.8  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.85 
 
 
840 aa  87.4  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  25 
 
 
546 aa  87.4  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  24.81 
 
 
689 aa  87  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.72 
 
 
780 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.87 
 
 
797 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  23.66 
 
 
752 aa  85.9  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.05 
 
 
773 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  28.41 
 
 
672 aa  81.6  0.00000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0304  ComEC/Rec2-related protein  22.25 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.32 
 
 
771 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  27.15 
 
 
674 aa  80.1  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.78 
 
 
840 aa  80.1  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00917  conserved inner membrane protein  23.93 
 
 
754 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.578469  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2730  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.93 
 
 
754 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  28.25 
 
 
511 aa  79.3  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.15 
 
 
773 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  29.28 
 
 
773 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1011  hypothetical protein  24.49 
 
 
754 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00460048  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00924  hypothetical protein  23.93 
 
 
754 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.630751  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2683  hypothetical protein  23.93 
 
 
754 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692344  normal  0.226957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.6 
 
 
809 aa  79.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3672  ComEC/Rec2-related protein  26.71 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1074  hypothetical protein  23.87 
 
 
754 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.361238  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2207  hypothetical protein  24.29 
 
 
754 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.01066  normal  0.239269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.32 
 
 
808 aa  77.4  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.61 
 
 
790 aa  77.4  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  27.91 
 
 
879 aa  77.4  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.59 
 
 
784 aa  76.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.83 
 
 
654 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.83 
 
 
772 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.83 
 
 
773 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.83 
 
 
772 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.13 
 
 
770 aa  74.7  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 
773 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.64 
 
 
773 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.63 
 
 
722 aa  73.6  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  27.17 
 
 
798 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  25.26 
 
 
706 aa  73.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  22.35 
 
 
720 aa  72  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  28.4 
 
 
754 aa  72.4  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.31 
 
 
682 aa  72.4  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.86 
 
 
841 aa  71.6  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  27.27 
 
 
531 aa  71.6  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.58 
 
 
837 aa  71.6  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  29.45 
 
 
697 aa  71.2  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24 
 
 
750 aa  70.9  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  24.66 
 
 
784 aa  70.5  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.91 
 
 
734 aa  70.5  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  27.22 
 
 
798 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  25.07 
 
 
671 aa  70.5  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  25.56 
 
 
684 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  26.86 
 
 
710 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  29.8 
 
 
829 aa  69.7  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  25.96 
 
 
872 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.99 
 
 
773 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13038 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  28.17 
 
 
810 aa  68.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.92 
 
 
860 aa  67.4  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0924  comEC/Rec2-like protein  24.55 
 
 
792 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.15 
 
 
749 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  24.27 
 
 
872 aa  66.6  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  25.22 
 
 
448 aa  66.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.73 
 
 
812 aa  65.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>