167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0304 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0304  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 		 358 aa  680    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3672  ComEC/Rec2-related protein  30.72 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347289  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  22.25 
 
 		 734 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  23.23 
 
 		 733 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.83 
 
 		 818 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.95 
 
 		 759 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  22.08 
 
 		 747 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.86 
 
 		 835 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.72 
 
 		 841 aa  73.2  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.05 
 
 		 896 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.45 
 
 		 722 aa  69.7  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  20 
 
 		 755 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  27.08 
 
 		 636 aa  69.3  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  24.91 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  29.5 
 
 		 604 aa  66.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  25.41 
 
 		 679 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.11 
 
 		 752 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.53 
 
 		 775 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1744  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  19.05 
 
 		 806 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  23.53 
 
 		 735 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.67 
 
 		 786 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  24.05 
 
 		 735 aa  63.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.56 
 
 		 794 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.98 
 
 		 757 aa  62.8  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.54 
 
 		 840 aa  62.8  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  22.95 
 
 		 678 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  24.15 
 
 		 626 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.61 
 
 		 773 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  23.83 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.32 
 
 		 773 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  28.51 
 
 		 551 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1958  hypothetical protein  24.29 
 
 		 763 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001218  normal  0.195131 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2578  hypothetical protein  24.29 
 
 		 763 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0251432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  21.76 
 
 		 722 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2666  hypothetical protein  24.29 
 
 		 763 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  24.39 
 
 		 795 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2301  competence family protein  31.17 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  23.92 
 
 		 706 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.51 
 
 		 749 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.01 
 
 		 737 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.75 
 
 		 780 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  29.91 
 
 		 773 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.68 
 
 		 784 aa  59.7  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.86 
 
 		 795 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  22.22 
 
 		 694 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.39 
 
 		 796 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  24.76 
 
 		 752 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.07 
 
 		 833 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.91 
 
 		 773 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.91 
 
 		 772 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.91 
 
 		 772 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.64 
 
 		 761 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2148  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.24 
 
 		 829 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.705314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.91 
 
 		 654 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  17.79 
 
 		 846 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 		 797 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2209  hypothetical protein  24.12 
 
 		 747 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.785174  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  25.85 
 
 		 689 aa  56.6  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  21.85 
 
 		 684 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  30.77 
 
 		 531 aa  56.2  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5080  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.29 
 
 		 832 aa  56.2  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.411729  normal  0.0251813 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  25.7 
 
 		 674 aa  55.8  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.28 
 
 		 800 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  18.93 
 
 		 843 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.01 
 
 		 839 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 		 778 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.56 
 
 		 801 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  20 
 
 		 799 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  17.02 
 
 		 791 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.33 
 
 		 878 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  18.5 
 
 		 469 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00917  conserved inner membrane protein  21.58 
 
 		 754 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.578469  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2730  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.58 
 
 		 754 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00924  hypothetical protein  21.58 
 
 		 754 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.630751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  22.18 
 
 		 747 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2683  hypothetical protein  21.58 
 
 		 754 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692344  normal  0.226957 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1074  hypothetical protein  19.81 
 
 		 754 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.361238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.43 
 
 		 770 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1470  ComEC/Rec2-related protein  22.73 
 
 		 609 aa  53.9  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2389  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.83 
 
 		 831 aa  53.5  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00142105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.32 
 
 		 773 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2177  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  19.51 
 
 		 740 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.75 
 
 		 773 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.52 
 
 		 734 aa  52.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1011  hypothetical protein  22.22 
 
 		 754 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00460048  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  25.79 
 
 		 672 aa  52.4  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2207  hypothetical protein  19.17 
 
 		 754 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.01066  normal  0.239269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3848  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.22 
 
 		 738 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1346  ComEC/Rec2-related protein  22.22 
 
 		 759 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.032062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1497  ComEC/Rec2-related protein  21.48 
 
 		 728 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.177997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.6 
 
 		 802 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  25.89 
 
 		 448 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  20.25 
 
 		 672 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.43 
 
 		 750 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1336  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  19.48 
 
 		 765 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62013 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  21.19 
 
 		 684 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2310  hypothetical protein  26.07 
 
 		 793 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2021  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.09 
 
 		 833 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.130557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.15 
 
 		 773 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.27 
 
 		 773 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13038 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>