227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07760 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
843 aa  1693    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.99 
 
 
734 aa  233  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.84 
 
 
781 aa  189  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0804  ComEC/Rec2-related protein  26.36 
 
 
795 aa  124  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.569588  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.5 
 
 
778 aa  107  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.53 
 
 
757 aa  93.6  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.03 
 
 
794 aa  90.9  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  31.39 
 
 
531 aa  88.2  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  28.28 
 
 
829 aa  87.4  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.86 
 
 
837 aa  85.1  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.44 
 
 
722 aa  85.1  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  36.46 
 
 
474 aa  84  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  24.35 
 
 
798 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.09 
 
 
786 aa  81.6  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  31.98 
 
 
825 aa  80.5  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.68 
 
 
761 aa  80.9  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  34.5 
 
 
872 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.57 
 
 
752 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  26.92 
 
 
694 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  29.41 
 
 
710 aa  79.7  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.31 
 
 
780 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  21.59 
 
 
748 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  34.95 
 
 
519 aa  78.6  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  28.37 
 
 
674 aa  78.6  0.0000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.04 
 
 
822 aa  77.4  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  22.02 
 
 
748 aa  77.4  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  23.19 
 
 
769 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  32.17 
 
 
514 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  26.06 
 
 
720 aa  76.6  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.84 
 
 
773 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  25.07 
 
 
734 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  28.07 
 
 
626 aa  73.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  25.68 
 
 
679 aa  73.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  24.23 
 
 
738 aa  73.6  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  31.97 
 
 
591 aa  73.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.07 
 
 
791 aa  72.8  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.83 
 
 
773 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.32 
 
 
770 aa  72.8  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  26.94 
 
 
636 aa  70.5  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  28.7 
 
 
672 aa  70.9  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  30.69 
 
 
784 aa  69.7  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.87 
 
 
775 aa  68.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  28.09 
 
 
708 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  30.14 
 
 
672 aa  68.6  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  30.56 
 
 
503 aa  68.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.53 
 
 
795 aa  68.6  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.24 
 
 
860 aa  68.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  24.38 
 
 
795 aa  68.6  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.09 
 
 
773 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1569  ComEC/Rec2-related protein  26.13 
 
 
801 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.66 
 
 
682 aa  68.2  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  29.96 
 
 
656 aa  67  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21 
 
 
801 aa  67.4  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  27.48 
 
 
671 aa  67.4  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
759 aa  67  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.98 
 
 
802 aa  66.6  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  27.67 
 
 
816 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.1 
 
 
773 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  29.8 
 
 
489 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1711  hypothetical protein  27.38 
 
 
737 aa  64.7  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0805358  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  24.89 
 
 
546 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.33 
 
 
773 aa  64.7  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.67 
 
 
841 aa  64.7  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  25.74 
 
 
872 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  25.36 
 
 
511 aa  63.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  29.96 
 
 
502 aa  63.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2301  competence family protein  24.62 
 
 
551 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  22.95 
 
 
773 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  29.71 
 
 
562 aa  62.8  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.86 
 
 
796 aa  62.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00917  conserved inner membrane protein  26.87 
 
 
754 aa  62  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.578469  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2730  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.87 
 
 
754 aa  62  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2683  hypothetical protein  26.87 
 
 
754 aa  62  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692344  normal  0.226957 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.51 
 
 
766 aa  62.4  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.3 
 
 
840 aa  62  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.23 
 
 
835 aa  62  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00924  hypothetical protein  26.87 
 
 
754 aa  62  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.630751  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.36 
 
 
790 aa  62.4  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.98 
 
 
818 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  27.78 
 
 
551 aa  62  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2564  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.32 
 
 
929 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0267783  normal  0.0941772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.02 
 
 
800 aa  61.6  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  29.8 
 
 
611 aa  61.6  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  31.92 
 
 
697 aa  61.6  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1202  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.85 
 
 
776 aa  61.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.177641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  29.9 
 
 
593 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  28.76 
 
 
719 aa  61.2  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 
773 aa  61.2  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 
654 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  24.46 
 
 
494 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 
772 aa  60.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  26.55 
 
 
684 aa  60.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 
772 aa  60.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.1 
 
 
868 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3512  ComEC/Rec2-related protein  33.14 
 
 
268 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2578  hypothetical protein  28.63 
 
 
763 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0251432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  27.32 
 
 
448 aa  60.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3584  ComEC/Rec2-related protein  33.14 
 
 
268 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  0.0166821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1011  hypothetical protein  24.87 
 
 
754 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00460048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1958  hypothetical protein  28.63 
 
 
763 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001218  normal  0.195131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>