183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3188 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
519 aa  978    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  44.08 
 
 
489 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  42.28 
 
 
514 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.88 
 
 
837 aa  210  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  45.07 
 
 
770 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  44.6 
 
 
790 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  43.75 
 
 
872 aa  193  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12442  hypothetical protein  39.41 
 
 
514 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  36.95 
 
 
798 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  46.53 
 
 
806 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  40.4 
 
 
819 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  39.88 
 
 
516 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3914  ComEC/Rec2-related protein  41.1 
 
 
488 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.475357  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  50.29 
 
 
806 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2802  ComEC/Rec2-related protein  46.42 
 
 
524 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.83 
 
 
812 aa  160  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  43.16 
 
 
784 aa  156  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3512  ComEC/Rec2-related protein  48.43 
 
 
268 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3584  ComEC/Rec2-related protein  48.43 
 
 
268 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  0.0166821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.11 
 
 
859 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  43.5 
 
 
829 aa  153  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  40 
 
 
781 aa  146  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  41.61 
 
 
800 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  34.96 
 
 
559 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  35.87 
 
 
656 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.11 
 
 
792 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  35.73 
 
 
710 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.03 
 
 
778 aa  120  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  42.67 
 
 
772 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  32.82 
 
 
474 aa  115  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  41.63 
 
 
821 aa  115  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  35.97 
 
 
867 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  36.36 
 
 
888 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.63 
 
 
786 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.85 
 
 
773 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  40.43 
 
 
502 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  33.92 
 
 
826 aa  97.8  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.44 
 
 
791 aa  97.4  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.46 
 
 
757 aa  94.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  33.61 
 
 
724 aa  94  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2210  ComEC/Rec2-related protein  37.97 
 
 
851 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.35 
 
 
773 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.67 
 
 
818 aa  92  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  34.15 
 
 
493 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  30.55 
 
 
546 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.71 
 
 
794 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.6 
 
 
796 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  28.57 
 
 
626 aa  87.8  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.21 
 
 
809 aa  87.4  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.35 
 
 
773 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.47 
 
 
752 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.4 
 
 
773 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.06 
 
 
773 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  30.83 
 
 
562 aa  84  0.000000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  28.57 
 
 
773 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.4 
 
 
795 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  29.66 
 
 
734 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  31.09 
 
 
816 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  36.99 
 
 
591 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  31.11 
 
 
694 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  30 
 
 
494 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  32.86 
 
 
787 aa  80.9  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  34.68 
 
 
843 aa  80.5  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.94 
 
 
780 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.36 
 
 
772 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.36 
 
 
772 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  27.6 
 
 
795 aa  80.5  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.08 
 
 
773 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.08 
 
 
654 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  25.88 
 
 
769 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  23.32 
 
 
720 aa  77.8  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  26.49 
 
 
879 aa  77.8  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  32.11 
 
 
531 aa  77  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.88 
 
 
722 aa  76.6  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  30.43 
 
 
671 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.34 
 
 
781 aa  76.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2301  competence family protein  30.77 
 
 
551 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  30.77 
 
 
551 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.52 
 
 
761 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2831  ComEC/Rec2-related protein  35.4 
 
 
523 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0669965  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  30.43 
 
 
799 aa  74.3  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  26.42 
 
 
684 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  38.04 
 
 
611 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1320  ComEC/Rec2-related protein  30.73 
 
 
524 aa  70.5  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.725773  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  23.96 
 
 
674 aa  70.5  0.00000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  27.98 
 
 
684 aa  70.1  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  26.82 
 
 
604 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.77 
 
 
789 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  28.15 
 
 
798 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  26.4 
 
 
717 aa  67.4  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  26.11 
 
 
747 aa  66.6  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  27.65 
 
 
872 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0924  comEC/Rec2-like protein  30.87 
 
 
792 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158151  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  27.88 
 
 
734 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.46 
 
 
734 aa  65.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  29.67 
 
 
672 aa  64.7  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.89 
 
 
775 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  25.45 
 
 
748 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  25.45 
 
 
748 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  31.76 
 
 
695 aa  63.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>