127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1320 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1320  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 		 524 aa  1018    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.725773  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.92 
 
 		 757 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.61 
 
 		 786 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0604  putative competence locus E  35.35 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.790814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.51 
 
 		 778 aa  77  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.73 
 
 		 794 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  25.1 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  28.23 
 
 		 748 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  25.08 
 
 		 531 aa  70.1  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  30.73 
 
 		 519 aa  70.1  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  27.08 
 
 		 748 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2301  competence family protein  30.81 
 
 		 551 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.05 
 
 		 780 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  30.81 
 
 		 551 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  25.51 
 
 		 872 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  25.48 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  27.8 
 
 		 798 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.4 
 
 		 791 aa  62.4  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  23.13 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  27.04 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.19 
 
 		 896 aa  61.6  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  26.15 
 
 		 769 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  27.55 
 
 		 879 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  29.2 
 
 		 816 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  26.43 
 
 		 733 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  25.68 
 
 		 516 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  26.88 
 
 		 724 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  27.02 
 
 		 734 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.52 
 
 		 790 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  27.52 
 
 		 591 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.51 
 
 		 837 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  27.49 
 
 		 706 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.67 
 
 		 682 aa  57.4  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.45 
 
 		 789 aa  57.4  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.63 
 
 		 773 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.32 
 
 		 797 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  26.34 
 
 		 679 aa  57  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  26.22 
 
 		 489 aa  57  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.21 
 
 		 771 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.77 
 
 		 800 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0243  ComEC/Rec2-related protein  24.75 
 
 		 369 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.11 
 
 		 818 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  28.7 
 
 		 722 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  25.97 
 
 		 747 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  22.48 
 
 		 720 aa  55.1  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.31 
 
 		 815 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.37 
 
 		 752 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0924  comEC/Rec2-like protein  26.56 
 
 		 792 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  28.07 
 
 		 734 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  24.89 
 
 		 626 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  26.27 
 
 		 494 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  28.5 
 
 		 773 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  23.36 
 
 		 493 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.5 
 
 		 773 aa  53.5  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  27.48 
 
 		 755 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.12 
 
 		 734 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  24.06 
 
 		 656 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  26.89 
 
 		 439 aa  53.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  29.35 
 
 		 708 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.58 
 
 		 770 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20431  hypothetical protein  32.94 
 
 		 711 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.58 
 
 		 835 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.45 
 
 		 773 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  27.97 
 
 		 736 aa  51.6  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.67 
 
 		 812 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2021  ComEC/Rec2-related protein  25 
 
 		 760 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  24.58 
 
 		 546 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.5 
 
 		 773 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.23 
 
 		 773 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  29.92 
 
 		 502 aa  50.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  31.06 
 
 		 611 aa  50.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  26.34 
 
 		 604 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1806  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30 
 
 		 804 aa  50.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  25.25 
 
 		 503 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.02 
 
 		 772 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.02 
 
 		 773 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.02 
 
 		 772 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  23.51 
 
 		 674 aa  49.3  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  26.06 
 
 		 562 aa  49.7  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0648  ComEC/Rec2-related protein  23.21 
 
 		 738 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.02 
 
 		 654 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.05 
 
 		 798 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  21.81 
 
 		 559 aa  49.3  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.2 
 
 		 808 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  26.75 
 
 		 757 aa  48.9  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  25.64 
 
 		 798 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  29.8 
 
 		 593 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  25.16 
 
 		 694 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.45 
 
 		 761 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5224  ComEC/Rec2-related protein  23.31 
 
 		 753 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  25.3 
 
 		 819 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.86 
 
 		 851 aa  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  27.15 
 
 		 843 aa  48.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.44 
 
 		 775 aa  47.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.86 
 
 		 859 aa  47  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.54 
 
 		 795 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  29.45 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3512  ComEC/Rec2-related protein  28.81 
 
 		 268 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  20.98 
 
 		 717 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3584  ComEC/Rec2-related protein  28.81 
 
 		 268 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  0.0166821 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>