More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5470 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
819 aa  1561    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  48.68 
 
 
806 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  47.89 
 
 
806 aa  475  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.03 
 
 
837 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  42.44 
 
 
872 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  41.01 
 
 
798 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.49 
 
 
790 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  41.95 
 
 
770 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.62 
 
 
772 aa  335  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  43.84 
 
 
859 aa  332  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.98 
 
 
792 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.46 
 
 
812 aa  323  6e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  39.15 
 
 
784 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  37.55 
 
 
781 aa  282  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  34.72 
 
 
829 aa  270  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  40.66 
 
 
516 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2210  ComEC/Rec2-related protein  38.19 
 
 
851 aa  231  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699709  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  30.63 
 
 
826 aa  229  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.4 
 
 
794 aa  211  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  35.55 
 
 
867 aa  209  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.41 
 
 
818 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.84 
 
 
778 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  32.38 
 
 
787 aa  194  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.52 
 
 
773 aa  189  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.27 
 
 
773 aa  188  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  39.95 
 
 
519 aa  189  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.59 
 
 
780 aa  185  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.04 
 
 
773 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  26.18 
 
 
773 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.02 
 
 
773 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.18 
 
 
654 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  36.82 
 
 
559 aa  179  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.6 
 
 
761 aa  178  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
773 aa  178  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.02 
 
 
772 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.02 
 
 
772 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.82 
 
 
795 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.31 
 
 
789 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.09 
 
 
773 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.28 
 
 
786 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  45.88 
 
 
800 aa  174  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  41.58 
 
 
514 aa  173  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.69 
 
 
757 aa  171  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  26.36 
 
 
795 aa  170  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.33 
 
 
796 aa  168  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.36 
 
 
759 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.69 
 
 
791 aa  160  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  34.33 
 
 
710 aa  159  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  38.6 
 
 
888 aa  156  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  37.9 
 
 
656 aa  156  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.98 
 
 
809 aa  155  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.44 
 
 
775 aa  150  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  44.27 
 
 
489 aa  147  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.42 
 
 
749 aa  146  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.4 
 
 
750 aa  142  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.78 
 
 
808 aa  134  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12442  hypothetical protein  36.12 
 
 
514 aa  132  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  30.8 
 
 
872 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  36.24 
 
 
821 aa  130  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  22.83 
 
 
746 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  28.5 
 
 
747 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.36 
 
 
798 aa  127  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.19 
 
 
797 aa  127  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.15 
 
 
781 aa  125  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  29.03 
 
 
284 aa  125  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  30.69 
 
 
443 aa  125  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.99 
 
 
734 aa  124  8e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3512  ComEC/Rec2-related protein  46.06 
 
 
268 aa  124  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3584  ComEC/Rec2-related protein  46.06 
 
 
268 aa  124  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  0.0166821 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.29 
 
 
682 aa  124  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3914  ComEC/Rec2-related protein  40.91 
 
 
488 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.475357  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.01 
 
 
814 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.17 
 
 
771 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  27.55 
 
 
847 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  30.98 
 
 
336 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.73 
 
 
833 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.61 
 
 
802 aa  119  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 
294 aa  119  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 
320 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  33.81 
 
 
348 aa  116  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23 
 
 
709 aa  115  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000127283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.04 
 
 
766 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  32.51 
 
 
451 aa  114  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1806  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.6 
 
 
804 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.63 
 
 
752 aa  112  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  31.65 
 
 
390 aa  112  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.11 
 
 
835 aa  111  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 
352 aa  111  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.99 
 
 
840 aa  111  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  29.64 
 
 
846 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2802  ComEC/Rec2-related protein  39.2 
 
 
524 aa  111  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1159  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.75 
 
 
819 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7076  beta-lactamase domain protein  50.83 
 
 
363 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.65 
 
 
840 aa  110  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.1 
 
 
883 aa  109  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0804  ComEC/Rec2-related protein  22.99 
 
 
795 aa  108  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.569588  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  27.5 
 
 
454 aa  108  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.57 
 
 
722 aa  108  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.57 
 
 
851 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.19 
 
 
860 aa  107  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>