More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1738 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  100 
 
 		 821 aa  1516    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  39.22 
 
 		 888 aa  364  4e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.22 
 
 		 837 aa  314  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  40.37 
 
 		 872 aa  311  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  33.8 
 
 		 826 aa  308  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  37.45 
 
 		 798 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  36.82 
 
 		 829 aa  295  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.51 
 
 		 859 aa  291  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.26 
 
 		 770 aa  287  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.23 
 
 		 792 aa  282  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  36.75 
 
 		 819 aa  264  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  41.05 
 
 		 772 aa  263  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.9 
 
 		 790 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.3 
 
 		 812 aa  252  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.55 
 
 		 806 aa  226  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  37.52 
 
 		 806 aa  212  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  50.52 
 
 		 800 aa  201  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  35.04 
 
 		 787 aa  198  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  36.82 
 
 		 867 aa  188  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2210  ComEC/Rec2-related protein  51.39 
 
 		 851 aa  177  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  39.94 
 
 		 516 aa  172  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  39.07 
 
 		 710 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  47.09 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  39 
 
 		 784 aa  162  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  36.88 
 
 		 656 aa  161  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.03 
 
 		 778 aa  155  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  40.63 
 
 		 514 aa  151  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  35.64 
 
 		 559 aa  147  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.25 
 
 		 773 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.37 
 
 		 773 aa  142  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.98 
 
 		 781 aa  141  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  43.75 
 
 		 781 aa  140  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  39.07 
 
 		 489 aa  140  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.66 
 
 		 773 aa  140  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7076  beta-lactamase domain protein  37.97 
 
 		 363 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  33.86 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.5 
 
 		 786 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.96 
 
 		 752 aa  134  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.42 
 
 		 773 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  30.43 
 
 		 562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.39 
 
 		 780 aa  131  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.34 
 
 		 794 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.21 
 
 		 773 aa  127  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.03 
 
 		 757 aa  126  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  42.58 
 
 		 519 aa  125  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  23.41 
 
 		 773 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.13 
 
 		 775 aa  121  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.5 
 
 		 773 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.45 
 
 		 654 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.55 
 
 		 722 aa  118  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.04 
 
 		 759 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  25.68 
 
 		 795 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  24.67 
 
 		 872 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.57 
 
 		 795 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.68 
 
 		 860 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.57 
 
 		 772 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.57 
 
 		 772 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.27 
 
 		 796 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.86 
 
 		 833 aa  110  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3914  ComEC/Rec2-related protein  38.27 
 
 		 488 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.475357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12442  hypothetical protein  37.33 
 
 		 514 aa  106  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1159  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.32 
 
 		 819 aa  105  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785752 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  30.17 
 
 		 825 aa  104  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.15 
 
 		 822 aa  104  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3512  ComEC/Rec2-related protein  42.21 
 
 		 268 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3584  ComEC/Rec2-related protein  42.21 
 
 		 268 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  0.0166821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2802  ComEC/Rec2-related protein  37.73 
 
 		 524 aa  102  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544709  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.97 
 
 		 840 aa  102  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0804  ComEC/Rec2-related protein  24.31 
 
 		 795 aa  100  9e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.569588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  29.08 
 
 		 461 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  29.08 
 
 		 461 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2389  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.55 
 
 		 831 aa  100  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00142105  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  24.38 
 
 		 735 aa  98.2  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  28.72 
 
 		 461 aa  98.2  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  23.59 
 
 		 735 aa  98.2  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  28.72 
 
 		 461 aa  98.2  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5417  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.51 
 
 		 830 aa  97.4  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.19 
 
 		 818 aa  97.4  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2564  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.39 
 
 		 929 aa  96.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0267783  normal  0.0941772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.49 
 
 		 883 aa  95.5  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.1 
 
 		 773 aa  95.5  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  27.92 
 
 		 461 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 283 aa  95.1  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01534  hypothetical protein  25.04 
 
 		 752 aa  94.7  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 		 682 aa  94.7  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  29.92 
 
 		 847 aa  94.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.79 
 
 		 801 aa  94.4  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  27.5 
 
 		 443 aa  94.4  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1569  ComEC/Rec2-related protein  27.87 
 
 		 801 aa  93.2  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  26.47 
 
 		 284 aa  92.4  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.87 
 
 		 808 aa  92.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.57 
 
 		 802 aa  91.7  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1890  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.27 
 
 		 845 aa  91.3  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  38.95 
 
 		 816 aa  91.3  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31 
 
 		 860 aa  90.1  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2581  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.42 
 
 		 856 aa  90.1  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 453 aa  89.4  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.96 
 
 		 750 aa  89.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.6 
 
 		 778 aa  89.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1711  hypothetical protein  27.53 
 
 		 737 aa  88.6  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0805358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>