167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2802 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2802  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
524 aa  964    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544709  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  43.77 
 
 
514 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  41.08 
 
 
519 aa  204  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  40.68 
 
 
489 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12442  hypothetical protein  40.37 
 
 
514 aa  195  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.84 
 
 
837 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3914  ComEC/Rec2-related protein  41.98 
 
 
488 aa  176  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.475357  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  42.05 
 
 
770 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  39.45 
 
 
872 aa  163  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  38.39 
 
 
798 aa  163  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  38.81 
 
 
784 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.19 
 
 
859 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.38 
 
 
790 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.85 
 
 
806 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  38.49 
 
 
888 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3512  ComEC/Rec2-related protein  48.37 
 
 
268 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3584  ComEC/Rec2-related protein  48.37 
 
 
268 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  0.0166821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  39.29 
 
 
806 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40 
 
 
812 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  41.35 
 
 
792 aa  126  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  34.75 
 
 
516 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  38.53 
 
 
821 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.27 
 
 
778 aa  117  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  34.35 
 
 
474 aa  116  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.18 
 
 
800 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  25.86 
 
 
562 aa  113  7.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  41.96 
 
 
502 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  32.85 
 
 
559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  33.43 
 
 
656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  38.66 
 
 
819 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  35.62 
 
 
781 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  38.71 
 
 
829 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  42.15 
 
 
867 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  29.62 
 
 
826 aa  108  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.04 
 
 
786 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  33.17 
 
 
710 aa  105  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  31.99 
 
 
493 aa  97.1  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  27.9 
 
 
626 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  31.29 
 
 
724 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.35 
 
 
752 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  29.21 
 
 
798 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.33 
 
 
772 aa  91.3  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.69 
 
 
809 aa  90.1  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  30.1 
 
 
769 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.67 
 
 
791 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  29.62 
 
 
816 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.21 
 
 
794 aa  88.2  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2210  ComEC/Rec2-related protein  40.7 
 
 
851 aa  87.4  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699709  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  27.09 
 
 
469 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  34.35 
 
 
503 aa  84  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  28.54 
 
 
546 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.38 
 
 
761 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  30.05 
 
 
694 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.09 
 
 
773 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0924  comEC/Rec2-like protein  27.87 
 
 
792 aa  80.5  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  28.79 
 
 
734 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  33.22 
 
 
591 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.4 
 
 
757 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.11 
 
 
818 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  29.17 
 
 
494 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  31.58 
 
 
671 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.04 
 
 
840 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.01 
 
 
795 aa  75.1  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  22.38 
 
 
531 aa  74.7  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.7 
 
 
734 aa  75.1  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.5 
 
 
773 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.6 
 
 
759 aa  73.9  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  37.8 
 
 
611 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  26.65 
 
 
843 aa  72.8  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1320  ComEC/Rec2-related protein  27.9 
 
 
524 aa  72.4  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.725773  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1470  ComEC/Rec2-related protein  26.05 
 
 
609 aa  72.4  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  26.05 
 
 
795 aa  71.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3519  hypothetical protein  33.59 
 
 
251 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  24.89 
 
 
551 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3592  hypothetical protein  33.59 
 
 
251 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  29.02 
 
 
684 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.85 
 
 
796 aa  72  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2301  competence family protein  24.89 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  22.84 
 
 
720 aa  70.9  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.18 
 
 
781 aa  71.2  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  29.37 
 
 
684 aa  70.5  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.58 
 
 
780 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.62 
 
 
773 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.26 
 
 
773 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  29.11 
 
 
689 aa  69.7  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  32.98 
 
 
787 aa  68.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  28.33 
 
 
636 aa  67.8  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 
841 aa  67.4  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  25.52 
 
 
604 aa  67.4  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  28.7 
 
 
672 aa  67  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  22.53 
 
 
679 aa  67  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  29.02 
 
 
872 aa  67  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  27.8 
 
 
748 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  27.8 
 
 
748 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.98 
 
 
797 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.91 
 
 
896 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  24.22 
 
 
593 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.52 
 
 
808 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  30 
 
 
531 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.15 
 
 
798 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>