113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3584 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  99.63 
 
 		 514 aa  477  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3512  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 		 268 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3584  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 		 268 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  0.0166821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  79.09 
 
 		 489 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12442  hypothetical protein  65.65 
 
 		 514 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3914  ComEC/Rec2-related protein  78.06 
 
 		 488 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.475357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  53.52 
 
 		 837 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  55.69 
 
 		 770 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  50 
 
 		 519 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  44.54 
 
 		 872 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  44.21 
 
 		 790 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  53.88 
 
 		 806 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  43.26 
 
 		 784 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  53 
 
 		 806 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  46.67 
 
 		 800 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  45.91 
 
 		 819 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  40.98 
 
 		 798 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2802  ComEC/Rec2-related protein  47.44 
 
 		 524 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544709  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  48.75 
 
 		 829 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  41.05 
 
 		 559 aa  95.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  39.92 
 
 		 888 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  42.34 
 
 		 859 aa  92  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  43.38 
 
 		 821 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  34.58 
 
 		 516 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  42.24 
 
 		 867 aa  88.2  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  35.95 
 
 		 656 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  48.2 
 
 		 792 aa  85.5  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  43.64 
 
 		 772 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  39.1 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.45 
 
 		 786 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  33.48 
 
 		 474 aa  75.5  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  35.96 
 
 		 710 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  41.51 
 
 		 826 aa  75.5  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  43.51 
 
 		 781 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  42.33 
 
 		 812 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0924  comEC/Rec2-like protein  30.17 
 
 		 792 aa  72.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158151  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  33.96 
 
 		 724 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.27 
 
 		 778 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  30.61 
 
 		 798 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  31.46 
 
 		 816 aa  69.3  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.68 
 
 		 818 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  34.17 
 
 		 843 aa  67.8  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.53 
 
 		 757 aa  66.6  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  44 
 
 		 502 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2210  ComEC/Rec2-related protein  42.29 
 
 		 851 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699709  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  30.08 
 
 		 769 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  31.64 
 
 		 717 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  32.89 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  33.13 
 
 		 469 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  27.8 
 
 		 734 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.85 
 
 		 752 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  34.97 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  29.2 
 
 		 795 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.93 
 
 		 734 aa  59.3  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.73 
 
 		 794 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  29.71 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.81 
 
 		 809 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  25.32 
 
 		 748 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  27.86 
 
 		 671 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  32.31 
 
 		 684 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  29.21 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  25.32 
 
 		 748 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.76 
 
 		 795 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.76 
 
 		 796 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  33.14 
 
 		 503 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32 
 
 		 791 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.27 
 
 		 761 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.4 
 
 		 781 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  30.4 
 
 		 684 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  29.35 
 
 		 872 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 		 773 aa  52.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  28.31 
 
 		 708 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  36.23 
 
 		 672 aa  52.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.09 
 
 		 896 aa  52.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  31.25 
 
 		 694 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1320  ComEC/Rec2-related protein  25 
 
 		 524 aa  52  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.725773  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  36.88 
 
 		 611 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  33.78 
 
 		 787 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20431  hypothetical protein  41.9 
 
 		 711 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192171 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1470  ComEC/Rec2-related protein  27.98 
 
 		 609 aa  50.4  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  31.11 
 
 		 733 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  27.52 
 
 		 773 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.52 
 
 		 772 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.52 
 
 		 773 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.52 
 
 		 772 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 		 780 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  28.36 
 
 		 604 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  30.09 
 
 		 778 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  31.1 
 
 		 762 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.52 
 
 		 654 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  30.5 
 
 		 636 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 		 773 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  29.55 
 
 		 689 aa  46.2  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  26.67 
 
 		 626 aa  45.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  33.57 
 
 		 722 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.77 
 
 		 808 aa  45.4  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.37 
 
 		 773 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  25.52 
 
 		 755 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.5 
 
 		 773 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3672  ComEC/Rec2-related protein  21.99 
 
 		 454 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>