168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12442 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12442  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  964    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  61.09 
 
 
489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  57.96 
 
 
514 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3914  ComEC/Rec2-related protein  58.7 
 
 
488 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.475357  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3512  ComEC/Rec2-related protein  65.65 
 
 
268 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3584  ComEC/Rec2-related protein  65.65 
 
 
268 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  0.0166821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  47.88 
 
 
837 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  48.94 
 
 
770 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  40.17 
 
 
519 aa  224  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  40.65 
 
 
872 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2802  ComEC/Rec2-related protein  43.53 
 
 
524 aa  176  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544709  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3519  hypothetical protein  48.78 
 
 
251 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3592  hypothetical protein  48.78 
 
 
251 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  46.21 
 
 
800 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  41.99 
 
 
790 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  46.81 
 
 
806 aa  160  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  46.5 
 
 
806 aa  160  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  38.57 
 
 
784 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  38.7 
 
 
798 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  37.56 
 
 
559 aa  143  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  34.78 
 
 
516 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  43.4 
 
 
792 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.25 
 
 
859 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  35.73 
 
 
829 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  36.12 
 
 
819 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.83 
 
 
812 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  41.14 
 
 
772 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  36.36 
 
 
781 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  38.04 
 
 
888 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  36.18 
 
 
710 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  39.91 
 
 
656 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  43.75 
 
 
502 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  38.44 
 
 
821 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.9 
 
 
778 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.61 
 
 
786 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  38.52 
 
 
867 aa  106  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  29.62 
 
 
826 aa  100  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  31.85 
 
 
474 aa  95.9  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  29.55 
 
 
562 aa  94  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.83 
 
 
752 aa  94  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.36 
 
 
757 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.68 
 
 
796 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  25 
 
 
795 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2210  ComEC/Rec2-related protein  40.34 
 
 
851 aa  91.3  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699709  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  31.07 
 
 
724 aa  90.9  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.72 
 
 
795 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  26.67 
 
 
469 aa  89.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.24 
 
 
773 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.68 
 
 
773 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.9 
 
 
818 aa  87.8  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.93 
 
 
809 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  32.99 
 
 
787 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.67 
 
 
761 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.95 
 
 
780 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.81 
 
 
773 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  24.63 
 
 
769 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.93 
 
 
791 aa  81.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.09 
 
 
794 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  30.65 
 
 
493 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  26.62 
 
 
872 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  31.31 
 
 
843 aa  80.1  0.00000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.94 
 
 
773 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.53 
 
 
734 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  26.06 
 
 
546 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  26.1 
 
 
494 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.92 
 
 
773 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  23.94 
 
 
773 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  31.11 
 
 
672 aa  74.7  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  25.61 
 
 
733 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  32.14 
 
 
531 aa  73.9  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2831  ComEC/Rec2-related protein  36.3 
 
 
523 aa  73.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0669965  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.12 
 
 
654 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.94 
 
 
772 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.94 
 
 
773 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.94 
 
 
772 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  36.46 
 
 
611 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  26.42 
 
 
684 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0924  comEC/Rec2-like protein  24.66 
 
 
792 aa  72  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3672  ComEC/Rec2-related protein  20.97 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347289  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  24.29 
 
 
671 aa  70.5  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  24.93 
 
 
684 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  28.33 
 
 
816 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  26.28 
 
 
798 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  24.48 
 
 
810 aa  67.4  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.7 
 
 
781 aa  67  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  34.91 
 
 
591 aa  66.6  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  26.07 
 
 
717 aa  66.6  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  28.03 
 
 
689 aa  66.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.12 
 
 
759 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  27.43 
 
 
604 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  23.25 
 
 
626 aa  65.1  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20431  hypothetical protein  37.68 
 
 
711 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  19.52 
 
 
678 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1320  ComEC/Rec2-related protein  24.49 
 
 
524 aa  64.3  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.725773  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  25.28 
 
 
879 aa  63.9  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  24.03 
 
 
694 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.26 
 
 
896 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  26.8 
 
 
734 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1497  ComEC/Rec2-related protein  24.03 
 
 
728 aa  62.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.177997  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.64 
 
 
682 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>