101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0942 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  100 
 
 		 562 aa  1158    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  39.28 
 
 		 474 aa  288  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  32.69 
 
 		 888 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  30.14 
 
 		 826 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  29.47 
 
 		 798 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  29.13 
 
 		 784 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  26.73 
 
 		 872 aa  100  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  30.26 
 
 		 821 aa  96.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.94 
 
 		 786 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2210  ComEC/Rec2-related protein  31.05 
 
 		 851 aa  90.5  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  27.19 
 
 		 656 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.23 
 
 		 757 aa  89.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.25 
 
 		 800 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.04 
 
 		 790 aa  87.4  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  33.15 
 
 		 798 aa  84.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.65 
 
 		 859 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.93 
 
 		 778 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  36.82 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  28.76 
 
 		 867 aa  82.8  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2802  ComEC/Rec2-related protein  25.93 
 
 		 524 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544709  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  33.18 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  36.36 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.37 
 
 		 770 aa  80.5  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  27.91 
 
 		 710 aa  80.1  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  33.33 
 
 		 724 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  30.41 
 
 		 816 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.83 
 
 		 752 aa  75.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  32.98 
 
 		 781 aa  74.7  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.95 
 
 		 794 aa  74.3  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0924  comEC/Rec2-like protein  28.7 
 
 		 792 aa  73.6  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158151  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  27.81 
 
 		 748 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  27.81 
 
 		 748 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  34.65 
 
 		 502 aa  72  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  23.84 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.06 
 
 		 837 aa  70.1  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  28.69 
 
 		 829 aa  69.7  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.78 
 
 		 780 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.95 
 
 		 818 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3512  ComEC/Rec2-related protein  41.22 
 
 		 268 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3584  ComEC/Rec2-related protein  41.22 
 
 		 268 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  0.0166821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  27.09 
 
 		 734 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12442  hypothetical protein  34.46 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  30.08 
 
 		 769 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  24.55 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.45 
 
 		 773 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  29.71 
 
 		 843 aa  62.4  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.51 
 
 		 812 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.12 
 
 		 773 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.22 
 
 		 722 aa  60.5  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  22.67 
 
 		 493 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.56 
 
 		 773 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.56 
 
 		 761 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.06 
 
 		 781 aa  59.3  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  29.32 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  24.17 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  27.6 
 
 		 626 aa  58.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  28.08 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  24.44 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.51 
 
 		 759 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.49 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.86 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  23.1 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.88 
 
 		 773 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2301  competence family protein  26.55 
 
 		 551 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  26.55 
 
 		 551 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  22.51 
 
 		 773 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  24.28 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  27.78 
 
 		 494 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  28.25 
 
 		 787 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.41 
 
 		 896 aa  55.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0804  ComEC/Rec2-related protein  23.41 
 
 		 795 aa  54.3  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.569588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.04 
 
 		 749 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 		 772 aa  54.3  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 		 773 aa  54.3  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 		 772 aa  54.3  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  29.9 
 
 		 531 aa  54.3  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  27.66 
 
 		 694 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 		 654 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  23.76 
 
 		 755 aa  53.9  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  28.05 
 
 		 591 aa  53.5  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28 
 
 		 806 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.84 
 
 		 809 aa  52.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 		 772 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  27.55 
 
 		 806 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1320  ComEC/Rec2-related protein  26.06 
 
 		 524 aa  50.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.725773  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.66 
 
 		 791 aa  50.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1470  ComEC/Rec2-related protein  22.36 
 
 		 609 aa  50.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0604  putative competence locus E  28.43 
 
 		 416 aa  50.4  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.790814  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  26.17 
 
 		 511 aa  50.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20431  hypothetical protein  26.17 
 
 		 711 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  24.65 
 
 		 678 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.95 
 
 		 773 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  29.19 
 
 		 611 aa  48.9  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2831  ComEC/Rec2-related protein  32.09 
 
 		 523 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0669965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  22.56 
 
 		 503 aa  47.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  24.34 
 
 		 819 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.63 
 
 		 797 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  26.14 
 
 		 872 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.83 
 
 		 798 aa  44.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  31.67 
 
 		 689 aa  44.7  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>