More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1143 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  64.04 
 
 
798 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  100 
 
 
859 aa  1576    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  53.53 
 
 
792 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  49.65 
 
 
872 aa  482  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  49.5 
 
 
812 aa  459  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  47.32 
 
 
784 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  49.21 
 
 
770 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  47.66 
 
 
837 aa  438  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  47.99 
 
 
806 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  47.03 
 
 
806 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  44.63 
 
 
790 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  46.63 
 
 
772 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  41.7 
 
 
819 aa  356  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  44.91 
 
 
781 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  38.03 
 
 
888 aa  321  3.9999999999999996e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  38.53 
 
 
829 aa  300  9e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  44.17 
 
 
516 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  38.41 
 
 
867 aa  221  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  41.04 
 
 
559 aa  222  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.99 
 
 
778 aa  218  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  31.23 
 
 
826 aa  217  9e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.87 
 
 
794 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  37.52 
 
 
787 aa  207  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  44.14 
 
 
800 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.08 
 
 
818 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.4 
 
 
757 aa  192  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  36.26 
 
 
656 aa  191  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.93 
 
 
780 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7076  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 
363 aa  184  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  40.19 
 
 
710 aa  180  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.84 
 
 
791 aa  179  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.59 
 
 
773 aa  177  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.34 
 
 
761 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.96 
 
 
786 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  42.64 
 
 
821 aa  175  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.45 
 
 
773 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  26.84 
 
 
795 aa  174  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.77 
 
 
795 aa  173  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.81 
 
 
773 aa  173  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.94 
 
 
809 aa  172  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  38.86 
 
 
519 aa  171  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.86 
 
 
773 aa  170  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.6 
 
 
773 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.89 
 
 
808 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.98 
 
 
796 aa  164  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.26 
 
 
775 aa  162  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  39.55 
 
 
514 aa  160  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.42 
 
 
789 aa  157  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  25.75 
 
 
773 aa  156  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.37 
 
 
773 aa  154  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.87 
 
 
752 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.37 
 
 
654 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.36 
 
 
759 aa  154  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.33 
 
 
749 aa  152  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.14 
 
 
734 aa  150  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.37 
 
 
772 aa  149  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.37 
 
 
772 aa  149  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.88 
 
 
750 aa  147  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.97 
 
 
781 aa  145  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2210  ComEC/Rec2-related protein  42.09 
 
 
851 aa  142  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699709  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.04 
 
 
883 aa  140  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  40.65 
 
 
502 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12442  hypothetical protein  38.83 
 
 
514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3914  ComEC/Rec2-related protein  41.92 
 
 
488 aa  129  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.475357  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  32.36 
 
 
352 aa  127  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.76 
 
 
814 aa  125  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.44 
 
 
835 aa  124  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 
295 aa  124  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  34.45 
 
 
489 aa  124  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  31.89 
 
 
294 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  25.78 
 
 
735 aa  123  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1680  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.54 
 
 
726 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00317004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.54 
 
 
726 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.550311  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.55 
 
 
682 aa  123  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2802  ComEC/Rec2-related protein  38.23 
 
 
524 aa  123  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.86 
 
 
846 aa  122  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2564  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.66 
 
 
929 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0267783  normal  0.0941772 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  30.77 
 
 
443 aa  120  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.94 
 
 
746 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  29.5 
 
 
292 aa  120  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  29.5 
 
 
291 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 
320 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 
451 aa  119  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.78 
 
 
771 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  25.51 
 
 
735 aa  118  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.26 
 
 
840 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 
406 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.24 
 
 
785 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.38 
 
 
802 aa  114  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.11 
 
 
840 aa  114  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 
367 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  21.78 
 
 
738 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.23 
 
 
797 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  32.55 
 
 
502 aa  113  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 
868 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  32.68 
 
 
474 aa  112  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.29 
 
 
766 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.17 
 
 
745 aa  111  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  29.88 
 
 
454 aa  110  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1159  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.7 
 
 
819 aa  110  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>