More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17410 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
787 aa  1487    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.2 
 
 
837 aa  250  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  34.8 
 
 
888 aa  241  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.32 
 
 
770 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.75 
 
 
812 aa  222  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  35.76 
 
 
872 aa  210  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.52 
 
 
772 aa  207  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.77 
 
 
790 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.3 
 
 
806 aa  202  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  32.96 
 
 
798 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  35.82 
 
 
806 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.36 
 
 
792 aa  188  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  34.13 
 
 
784 aa  183  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.87 
 
 
778 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.76 
 
 
859 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  30 
 
 
826 aa  169  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  32.96 
 
 
829 aa  169  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  29.89 
 
 
819 aa  169  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  33.55 
 
 
867 aa  167  9e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.56 
 
 
794 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.18 
 
 
818 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.73 
 
 
780 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.24 
 
 
786 aa  164  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.76 
 
 
773 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.27 
 
 
773 aa  159  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.49 
 
 
773 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.08 
 
 
796 aa  154  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  24.2 
 
 
773 aa  154  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.12 
 
 
773 aa  153  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.43 
 
 
761 aa  152  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  27.17 
 
 
795 aa  150  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.32 
 
 
773 aa  150  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24 
 
 
757 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.23 
 
 
795 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.77 
 
 
773 aa  144  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.42 
 
 
759 aa  142  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 
654 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  32.51 
 
 
821 aa  140  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.16 
 
 
789 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.77 
 
 
772 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.77 
 
 
772 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.45 
 
 
814 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.92 
 
 
734 aa  135  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.08 
 
 
752 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2210  ComEC/Rec2-related protein  39.13 
 
 
851 aa  131  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699709  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  42.2 
 
 
800 aa  127  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.62 
 
 
809 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0804  ComEC/Rec2-related protein  24.96 
 
 
795 aa  125  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.569588  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  38.17 
 
 
710 aa  118  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.89 
 
 
791 aa  118  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.47 
 
 
781 aa  117  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.6 
 
 
808 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.37 
 
 
750 aa  115  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.62 
 
 
840 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  34.42 
 
 
516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.74 
 
 
771 aa  109  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.19 
 
 
868 aa  107  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.26 
 
 
797 aa  107  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7076  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 
363 aa  107  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2310  hypothetical protein  28.03 
 
 
793 aa  107  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.09 
 
 
775 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.75 
 
 
860 aa  106  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  24.59 
 
 
284 aa  106  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  37.37 
 
 
656 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01534  hypothetical protein  24.61 
 
 
752 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.29 
 
 
948 aa  103  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.62 
 
 
840 aa  103  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1806  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.51 
 
 
804 aa  103  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  40.63 
 
 
502 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.49 
 
 
682 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.05 
 
 
798 aa  102  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2666  hypothetical protein  25.88 
 
 
763 aa  102  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2578  hypothetical protein  25.88 
 
 
763 aa  101  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0251432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1958  hypothetical protein  25.54 
 
 
763 aa  99.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001218  normal  0.195131 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.21 
 
 
883 aa  99.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.73 
 
 
749 aa  99  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  24.6 
 
 
752 aa  99.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  34.78 
 
 
559 aa  99  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.05 
 
 
860 aa  98.6  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2209  hypothetical protein  28.38 
 
 
747 aa  98.6  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.785174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  27.21 
 
 
294 aa  97.8  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 
421 aa  97.4  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  34.98 
 
 
514 aa  97.4  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2803  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.61 
 
 
769 aa  97.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  34.86 
 
 
781 aa  97.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.71 
 
 
802 aa  97.1  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  28.47 
 
 
454 aa  97.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00591  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.38 
 
 
776 aa  95.9  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0903265  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.73 
 
 
766 aa  96.3  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
406 aa  95.9  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.62 
 
 
878 aa  95.9  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 
352 aa  94.7  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  27.27 
 
 
747 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 
320 aa  94  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  23.85 
 
 
746 aa  93.6  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.57 
 
 
772 aa  93.2  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  23.7 
 
 
295 aa  93.2  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2040  hypothetical protein  23.95 
 
 
763 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 
453 aa  93.2  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  33.89 
 
 
531 aa  92  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>