255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7076 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7076  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
363 aa  711    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  49.13 
 
 
772 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  44.44 
 
 
872 aa  200  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  43.54 
 
 
806 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  43.9 
 
 
806 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.44 
 
 
837 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  42.66 
 
 
859 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  39.94 
 
 
819 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  40.99 
 
 
798 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  41.53 
 
 
812 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  41.3 
 
 
792 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  43.84 
 
 
790 aa  169  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2210  ComEC/Rec2-related protein  38.19 
 
 
851 aa  166  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.22 
 
 
770 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  40.85 
 
 
781 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  41.49 
 
 
784 aa  155  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.77 
 
 
800 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  36.52 
 
 
888 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  31.08 
 
 
284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  37.89 
 
 
821 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.16 
 
 
789 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 
300 aa  116  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  30.08 
 
 
443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  34.15 
 
 
829 aa  113  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.89 
 
 
818 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  31.25 
 
 
787 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  24.61 
 
 
406 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 
294 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 
295 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
451 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 
281 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  31.21 
 
 
826 aa  103  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  35.35 
 
 
867 aa  102  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 
283 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 
352 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.85 
 
 
749 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.87 
 
 
778 aa  99.4  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.41 
 
 
775 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  30.41 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.21 
 
 
794 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.21 
 
 
783 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.69 
 
 
773 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.01 
 
 
654 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  28.11 
 
 
872 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  26.3 
 
 
454 aa  93.6  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.96 
 
 
761 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.39 
 
 
808 aa  94  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  30 
 
 
461 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
367 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1890  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.35 
 
 
845 aa  93.2  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.18 
 
 
791 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.69 
 
 
734 aa  92.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.98 
 
 
773 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
745 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  30.68 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  29.64 
 
 
461 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  27.1 
 
 
773 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  28.32 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 
421 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  29.04 
 
 
318 aa  90.1  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.98 
 
 
773 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.69 
 
 
772 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.69 
 
 
772 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  26.1 
 
 
336 aa  89.7  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  29.29 
 
 
461 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  29.29 
 
 
461 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.33 
 
 
773 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.97 
 
 
773 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  26.79 
 
 
502 aa  86.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.13 
 
 
868 aa  86.3  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  25.86 
 
 
292 aa  86.3  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.11 
 
 
773 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.05 
 
 
780 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  25.62 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  28.52 
 
 
795 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2940  beta-lactamase domain-containing protein  29.43 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.9 
 
 
750 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0804  ComEC/Rec2-related protein  30.04 
 
 
795 aa  84  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.569588  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.58 
 
 
781 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 
451 aa  84  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.31 
 
 
811 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  31.45 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.32 
 
 
757 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.6 
 
 
840 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.11 
 
 
752 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.13 
 
 
759 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  25.18 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1693  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.56 
 
 
842 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.891985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2581  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.56 
 
 
856 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1779  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.98 
 
 
762 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2636  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.56 
 
 
856 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0667077  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1471  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.56 
 
 
856 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.300879  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2198  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.56 
 
 
856 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975554  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3120  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.56 
 
 
856 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2715  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.56 
 
 
842 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1711  hypothetical protein  27.27 
 
 
737 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0805358  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.15 
 
 
772 aa  80.1  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.35 
 
 
786 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>