130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0330 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  100 
 
 		 474 aa  954    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  39.28 
 
 		 562 aa  288  2e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  31.36 
 
 		 888 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.05 
 
 		 790 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  33.19 
 
 		 784 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  32.39 
 
 		 516 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  39.04 
 
 		 519 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  33.24 
 
 		 821 aa  106  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  29.43 
 
 		 872 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  33.23 
 
 		 798 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.41 
 
 		 800 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  28.91 
 
 		 656 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.19 
 
 		 837 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.4 
 
 		 770 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  33.86 
 
 		 710 aa  94  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2210  ComEC/Rec2-related protein  34.88 
 
 		 851 aa  93.2  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699709  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  31.99 
 
 		 514 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.95 
 
 		 859 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  30.48 
 
 		 826 aa  90.1  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  29.7 
 
 		 829 aa  89.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.73 
 
 		 792 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2802  ComEC/Rec2-related protein  32.48 
 
 		 524 aa  87.4  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.11 
 
 		 806 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.14 
 
 		 781 aa  85.9  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  30.27 
 
 		 867 aa  85.9  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  32.45 
 
 		 781 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  36.46 
 
 		 843 aa  84  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  28.82 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.01 
 
 		 752 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.41 
 
 		 778 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.47 
 
 		 757 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  34.26 
 
 		 787 aa  77  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  29.97 
 
 		 559 aa  76.6  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  29.15 
 
 		 694 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  32.49 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.64 
 
 		 786 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28 
 
 		 794 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  29.65 
 
 		 626 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 		 773 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  26.85 
 
 		 769 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.75 
 
 		 734 aa  72.8  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1320  ComEC/Rec2-related protein  25.1 
 
 		 524 aa  71.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.725773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.86 
 
 		 812 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  28.8 
 
 		 819 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.58 
 
 		 772 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  30.28 
 
 		 806 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3512  ComEC/Rec2-related protein  36.17 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3584  ComEC/Rec2-related protein  36.17 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  0.0166821 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.04 
 
 		 896 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0804  ComEC/Rec2-related protein  25.58 
 
 		 795 aa  67.4  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.569588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.18 
 
 		 780 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  28.86 
 
 		 816 aa  67  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  25.57 
 
 		 734 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  31.49 
 
 		 591 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  23.63 
 
 		 679 aa  66.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 		 761 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  28.57 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.38 
 
 		 773 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  25.68 
 
 		 604 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  31.94 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1470  ComEC/Rec2-related protein  22.28 
 
 		 609 aa  63.2  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1806  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.99 
 
 		 804 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.17 
 
 		 773 aa  63.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.97 
 
 		 773 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  28 
 
 		 798 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12442  hypothetical protein  28.75 
 
 		 514 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  27.32 
 
 		 551 aa  60.1  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  28.73 
 
 		 724 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2301  competence family protein  27.32 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  24.49 
 
 		 748 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  24.49 
 
 		 748 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.11 
 
 		 818 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.86 
 
 		 759 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  26.7 
 
 		 593 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.27 
 
 		 722 aa  57.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  27.1 
 
 		 773 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.5 
 
 		 796 aa  57.4  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0924  comEC/Rec2-like protein  24.39 
 
 		 792 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  22.47 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  30.29 
 
 		 795 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  31.89 
 
 		 611 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.38 
 
 		 654 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  26.77 
 
 		 720 aa  54.3  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.38 
 
 		 772 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.38 
 
 		 773 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.38 
 
 		 772 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3914  ComEC/Rec2-related protein  34.1 
 
 		 488 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.475357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20431  hypothetical protein  33.54 
 
 		 711 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192171 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.65 
 
 		 795 aa  53.9  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.42 
 
 		 766 aa  53.5  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.81 
 
 		 773 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.9 
 
 		 835 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.49 
 
 		 802 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  25.42 
 
 		 706 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0604  putative competence locus E  26.7 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.790814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  21.61 
 
 		 531 aa  52  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  27.21 
 
 		 719 aa  51.2  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  24.79 
 
 		 747 aa  51.2  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.48 
 
 		 771 aa  50.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.69 
 
 		 798 aa  50.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>