261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3646 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
493 aa  977    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  41.96 
 
 
546 aa  315  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  41.13 
 
 
494 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  37.45 
 
 
503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.88 
 
 
778 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.46 
 
 
786 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.52 
 
 
796 aa  156  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.27 
 
 
794 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.18 
 
 
795 aa  154  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  28.54 
 
 
795 aa  154  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.31 
 
 
791 aa  143  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.31 
 
 
818 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.6 
 
 
752 aa  137  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.74 
 
 
757 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  28.6 
 
 
531 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  27.49 
 
 
469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  25.76 
 
 
734 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.58 
 
 
759 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  24.83 
 
 
748 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  25.38 
 
 
636 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  24.83 
 
 
748 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.17 
 
 
809 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  27.46 
 
 
626 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  25.29 
 
 
679 aa  107  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  28.97 
 
 
798 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  28.99 
 
 
816 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.2 
 
 
789 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.12 
 
 
773 aa  104  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.24 
 
 
797 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.75 
 
 
780 aa  103  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  26.28 
 
 
734 aa  103  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.71 
 
 
761 aa  103  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.82 
 
 
773 aa  103  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  25 
 
 
708 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  28.42 
 
 
733 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  30.98 
 
 
784 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.67 
 
 
773 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.38 
 
 
773 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  23.08 
 
 
678 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  25.15 
 
 
604 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.97 
 
 
654 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.09 
 
 
772 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.09 
 
 
773 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.09 
 
 
772 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  25.61 
 
 
879 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.08 
 
 
770 aa  98.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  32.67 
 
 
514 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  25.19 
 
 
773 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.03 
 
 
773 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1470  ComEC/Rec2-related protein  25.49 
 
 
609 aa  97.1  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0924  comEC/Rec2-like protein  27.02 
 
 
792 aa  95.9  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  34.01 
 
 
519 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0644  ComEC/Rec2-related protein  28.69 
 
 
700 aa  95.1  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.851772  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0484  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.69 
 
 
736 aa  94.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.4 
 
 
814 aa  94.7  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  28.4 
 
 
755 aa  92.8  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.03 
 
 
837 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  29.81 
 
 
724 aa  91.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2831  ComEC/Rec2-related protein  33.03 
 
 
523 aa  90.9  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0669965  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  27.17 
 
 
769 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  28.09 
 
 
694 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  33.66 
 
 
872 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.94 
 
 
775 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  30.91 
 
 
511 aa  88.2  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  20.48 
 
 
674 aa  88.2  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1497  ComEC/Rec2-related protein  22.95 
 
 
728 aa  87.8  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.177997  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3672  ComEC/Rec2-related protein  22.93 
 
 
454 aa  87  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347289  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  27.98 
 
 
489 aa  87  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
798 aa  87  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  24.95 
 
 
706 aa  87  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.32 
 
 
771 aa  86.7  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.44 
 
 
808 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.86 
 
 
777 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  26.11 
 
 
593 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  32.68 
 
 
611 aa  83.6  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.36 
 
 
840 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  23.76 
 
 
747 aa  81.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.99 
 
 
896 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.17 
 
 
722 aa  81.3  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.29 
 
 
734 aa  80.9  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  25.24 
 
 
722 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.41 
 
 
749 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  22.26 
 
 
720 aa  79.7  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.96 
 
 
682 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2802  ComEC/Rec2-related protein  31.68 
 
 
524 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  30.18 
 
 
710 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  28.32 
 
 
872 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.36 
 
 
770 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  25.21 
 
 
531 aa  77.8  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.07 
 
 
800 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.28 
 
 
772 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  28.97 
 
 
591 aa  76.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  29.23 
 
 
798 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.74 
 
 
802 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  23.3 
 
 
684 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.29 
 
 
801 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  23.81 
 
 
684 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  22.82 
 
 
672 aa  75.1  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.43 
 
 
811 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  25.59 
 
 
671 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>