278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2101 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
636 aa  1287    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  33.94 
 
 
679 aa  327  5e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  30.54 
 
 
678 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  29.92 
 
 
694 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  27.52 
 
 
604 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  35.31 
 
 
706 aa  167  5e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  27.54 
 
 
708 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  27.63 
 
 
593 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.66 
 
 
791 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.69 
 
 
786 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  25.96 
 
 
626 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
778 aa  135  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.54 
 
 
794 aa  134  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.44 
 
 
752 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.07 
 
 
757 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.83 
 
 
818 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.55 
 
 
761 aa  126  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.29 
 
 
759 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  27.13 
 
 
546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.36 
 
 
780 aa  118  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  27.83 
 
 
494 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  26.77 
 
 
503 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.23 
 
 
840 aa  113  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1470  ComEC/Rec2-related protein  27.13 
 
 
609 aa  110  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.75 
 
 
773 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  24.85 
 
 
748 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.17 
 
 
797 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.22 
 
 
798 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.25 
 
 
795 aa  104  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  24.25 
 
 
795 aa  104  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  25.52 
 
 
493 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  24.51 
 
 
748 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  34.33 
 
 
734 aa  104  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.51 
 
 
771 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.44 
 
 
773 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.74 
 
 
773 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  32.34 
 
 
511 aa  100  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  25.52 
 
 
531 aa  100  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.41 
 
 
682 aa  100  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  31.02 
 
 
872 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1497  ComEC/Rec2-related protein  29.64 
 
 
728 aa  99  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.177997  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.77 
 
 
808 aa  98.6  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.92 
 
 
789 aa  98.2  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.39 
 
 
773 aa  97.8  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.92 
 
 
796 aa  97.1  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.93 
 
 
809 aa  95.9  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  25 
 
 
674 aa  96.3  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  25.29 
 
 
733 aa  96.3  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3672  ComEC/Rec2-related protein  27.91 
 
 
454 aa  95.1  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  27.69 
 
 
816 aa  94.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.33 
 
 
773 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.53 
 
 
749 aa  94  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  23.66 
 
 
773 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  26.1 
 
 
734 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.15 
 
 
772 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.81 
 
 
773 aa  91.3  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.15 
 
 
772 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.55 
 
 
654 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  27.18 
 
 
755 aa  90.9  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  23.02 
 
 
694 aa  90.5  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  28.96 
 
 
722 aa  90.1  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.15 
 
 
734 aa  90.1  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  27.43 
 
 
798 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  23.7 
 
 
879 aa  88.6  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  28.04 
 
 
769 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2301  competence family protein  24.73 
 
 
551 aa  87.8  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.3 
 
 
777 aa  87.4  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.73 
 
 
775 aa  87.4  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  24.73 
 
 
551 aa  87  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  27.11 
 
 
531 aa  86.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  20.42 
 
 
672 aa  85.5  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  24.68 
 
 
469 aa  84.7  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  27.68 
 
 
448 aa  84.3  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  23.55 
 
 
684 aa  84  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.44 
 
 
722 aa  84  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  22.16 
 
 
689 aa  84  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  22.86 
 
 
720 aa  83.6  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  23.94 
 
 
672 aa  83.2  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.33 
 
 
750 aa  82.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.85 
 
 
841 aa  82.8  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  21.88 
 
 
724 aa  82.8  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.37 
 
 
811 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  23.55 
 
 
684 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1744  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.38 
 
 
806 aa  82  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  22.47 
 
 
706 aa  80.5  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0304  ComEC/Rec2-related protein  27.08 
 
 
358 aa  80.5  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.82 
 
 
770 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.05 
 
 
797 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.27 
 
 
814 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.99 
 
 
868 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  29.47 
 
 
747 aa  77.8  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  23.18 
 
 
717 aa  77.8  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.22 
 
 
840 aa  76.6  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  25.6 
 
 
843 aa  77  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.56 
 
 
896 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0764  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.45 
 
 
811 aa  74.7  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.804759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.84 
 
 
860 aa  74.3  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  24.76 
 
 
697 aa  74.3  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  24.04 
 
 
736 aa  73.9  0.000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  22.83 
 
 
671 aa  73.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>