271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0978 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
722 aa  1459    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1497  ComEC/Rec2-related protein  46.13 
 
 
728 aa  608  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.177997  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  40.82 
 
 
734 aa  535  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  39.31 
 
 
733 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  36.43 
 
 
747 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  37.27 
 
 
755 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1346  ComEC/Rec2-related protein  37.55 
 
 
759 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.032062  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.37 
 
 
778 aa  147  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.43 
 
 
818 aa  146  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.83 
 
 
757 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.29 
 
 
761 aa  137  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.45 
 
 
752 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  29.02 
 
 
708 aa  123  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  26.42 
 
 
679 aa  120  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.85 
 
 
775 aa  120  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  29.76 
 
 
593 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.27 
 
 
796 aa  117  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28 
 
 
791 aa  114  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.37 
 
 
786 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.6 
 
 
794 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  29.65 
 
 
706 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  24.77 
 
 
694 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.47 
 
 
809 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.96 
 
 
797 aa  109  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.5 
 
 
896 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.57 
 
 
795 aa  106  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  29.21 
 
 
678 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  21.38 
 
 
795 aa  102  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.98 
 
 
798 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.91 
 
 
771 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  25.08 
 
 
604 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.86 
 
 
780 aa  97.8  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  24.77 
 
 
626 aa  97.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.99 
 
 
789 aa  95.1  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  28.75 
 
 
636 aa  95.1  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.93 
 
 
846 aa  91.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.75 
 
 
773 aa  91.3  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  21.56 
 
 
531 aa  90.9  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  28.39 
 
 
689 aa  90.9  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.55 
 
 
750 aa  90.5  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  26.01 
 
 
503 aa  89  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.55 
 
 
808 aa  87.4  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.5 
 
 
759 aa  87.4  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  24.06 
 
 
816 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  24.71 
 
 
798 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  27.86 
 
 
511 aa  85.5  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  26.3 
 
 
546 aa  85.1  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.17 
 
 
773 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.6 
 
 
770 aa  84.3  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  21.7 
 
 
879 aa  84.3  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.35 
 
 
773 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  21.13 
 
 
773 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.83 
 
 
772 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.37 
 
 
734 aa  81.3  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.83 
 
 
772 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  23.89 
 
 
720 aa  80.9  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.83 
 
 
773 aa  80.9  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.22 
 
 
814 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.9 
 
 
722 aa  79.7  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  29.6 
 
 
531 aa  79  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  22.93 
 
 
825 aa  77.8  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.06 
 
 
749 aa  77.4  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.02 
 
 
784 aa  77  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  25.24 
 
 
493 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.04 
 
 
868 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.93 
 
 
773 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  19.93 
 
 
773 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  28.42 
 
 
672 aa  75.1  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.28 
 
 
682 aa  74.3  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1202  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23 
 
 
776 aa  73.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.177641 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.19 
 
 
841 aa  73.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.03 
 
 
822 aa  73.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  28.42 
 
 
748 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  24.17 
 
 
752 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.03 
 
 
654 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  25.12 
 
 
494 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.49 
 
 
837 aa  73.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  27.85 
 
 
697 aa  72.4  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.43 
 
 
797 aa  72  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  25.47 
 
 
448 aa  72  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0764  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.44 
 
 
811 aa  72  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.804759 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3672  ComEC/Rec2-related protein  28.24 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347289  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  28.08 
 
 
748 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  31.75 
 
 
872 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1022  recombination protein 2  23.49 
 
 
808 aa  70.1  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.949854  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.36 
 
 
766 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  31.67 
 
 
821 aa  69.3  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.27 
 
 
801 aa  68.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  24.86 
 
 
769 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  24.52 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.63 
 
 
811 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.64 
 
 
840 aa  68.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.96 
 
 
790 aa  67  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  27.27 
 
 
469 aa  67  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.03 
 
 
840 aa  67  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.94 
 
 
777 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1411  ComEC/Rec2-related protein  25.09 
 
 
792 aa  66.6  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1074  hypothetical protein  22.9 
 
 
754 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.361238  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.76 
 
 
773 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13038 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  23.51 
 
 
717 aa  66.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>