262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1722 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  61.66 
 
 
734 aa  878    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  52.33 
 
 
755 aa  718    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  57.89 
 
 
747 aa  842    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
733 aa  1474    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1346  ComEC/Rec2-related protein  40.14 
 
 
759 aa  532  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.032062  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  39.31 
 
 
722 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1497  ComEC/Rec2-related protein  37.57 
 
 
728 aa  445  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.177997  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.69 
 
 
778 aa  158  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.01 
 
 
752 aa  157  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.49 
 
 
786 aa  124  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.23 
 
 
757 aa  124  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.58 
 
 
818 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.63 
 
 
796 aa  122  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  28.15 
 
 
546 aa  119  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.68 
 
 
794 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  25.82 
 
 
593 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  27.03 
 
 
694 aa  114  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.41 
 
 
896 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.09 
 
 
791 aa  112  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.45 
 
 
795 aa  109  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  26.64 
 
 
795 aa  107  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  30.11 
 
 
626 aa  105  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  24.61 
 
 
604 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.8 
 
 
789 aa  101  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.8 
 
 
797 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.09 
 
 
761 aa  100  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  25.81 
 
 
494 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  29.74 
 
 
679 aa  100  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.71 
 
 
809 aa  98.2  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  27.87 
 
 
531 aa  97.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  26.05 
 
 
689 aa  95.1  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  26.51 
 
 
678 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.12 
 
 
798 aa  91.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  25.96 
 
 
706 aa  91.7  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  27.27 
 
 
493 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.87 
 
 
840 aa  90.1  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  24.4 
 
 
752 aa  90.1  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.66 
 
 
784 aa  89.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.03 
 
 
775 aa  89.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  28.81 
 
 
708 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.96 
 
 
770 aa  88.2  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.4 
 
 
773 aa  88.2  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.81 
 
 
759 aa  87  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  28.14 
 
 
636 aa  87  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2207  hypothetical protein  25.63 
 
 
754 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.01066  normal  0.239269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.32 
 
 
771 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  30.36 
 
 
511 aa  85.5  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00917  conserved inner membrane protein  24.71 
 
 
754 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.578469  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2730  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.71 
 
 
754 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00924  hypothetical protein  24.71 
 
 
754 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.630751  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2683  hypothetical protein  24.71 
 
 
754 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692344  normal  0.226957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.88 
 
 
750 aa  84  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1011  hypothetical protein  25.57 
 
 
754 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00460048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.27 
 
 
773 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.22 
 
 
840 aa  83.2  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.7 
 
 
797 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.22 
 
 
780 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  27.6 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1074  hypothetical protein  24.94 
 
 
754 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.361238  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  26.36 
 
 
674 aa  80.1  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0304  ComEC/Rec2-related protein  23.23 
 
 
358 aa  79.7  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  29.28 
 
 
872 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.31 
 
 
837 aa  78.2  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.32 
 
 
801 aa  77.8  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  22.36 
 
 
720 aa  77.4  0.0000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  24.59 
 
 
773 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  25.2 
 
 
784 aa  76.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  23.71 
 
 
672 aa  75.9  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.59 
 
 
654 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.86 
 
 
772 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.59 
 
 
773 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.86 
 
 
772 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.05 
 
 
773 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  27.41 
 
 
748 aa  74.3  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  23.44 
 
 
503 aa  74.3  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  23.51 
 
 
825 aa  73.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.01 
 
 
773 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  27.41 
 
 
748 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.02 
 
 
734 aa  73.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.93 
 
 
860 aa  72.4  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1202  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.4 
 
 
776 aa  72  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.177641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  27.86 
 
 
798 aa  71.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  28.57 
 
 
710 aa  71.2  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  21.68 
 
 
734 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  29.2 
 
 
697 aa  71.2  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.96 
 
 
766 aa  71.2  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  24.13 
 
 
702 aa  71.2  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  25.95 
 
 
754 aa  70.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  24.36 
 
 
879 aa  70.1  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  25.23 
 
 
684 aa  70.5  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.77 
 
 
841 aa  70.5  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  31.03 
 
 
829 aa  70.5  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.01 
 
 
790 aa  70.1  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3672  ComEC/Rec2-related protein  25.26 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  24.77 
 
 
872 aa  69.7  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  27.07 
 
 
448 aa  68.9  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.94 
 
 
815 aa  68.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.12 
 
 
808 aa  68.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1097  hypothetical protein  22.33 
 
 
756 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.89 
 
 
777 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>