235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1270 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
439 aa  852    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  28.35 
 
 
604 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.54 
 
 
759 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.33 
 
 
773 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.83 
 
 
773 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  34.38 
 
 
448 aa  92.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 
795 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.12 
 
 
796 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.16 
 
 
773 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.14 
 
 
757 aa  91.3  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.65 
 
 
773 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  31.6 
 
 
706 aa  89.7  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  31.63 
 
 
531 aa  89.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  27.27 
 
 
795 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  29.29 
 
 
708 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  31.03 
 
 
694 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  31.28 
 
 
773 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  27.42 
 
 
626 aa  87.8  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32 
 
 
773 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.28 
 
 
772 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.28 
 
 
773 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.28 
 
 
772 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  27.6 
 
 
733 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.28 
 
 
798 aa  86.7  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.28 
 
 
654 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.28 
 
 
761 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.9 
 
 
780 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  27.19 
 
 
511 aa  84  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  31.35 
 
 
593 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  27.83 
 
 
720 aa  82.4  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  24.81 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  28.52 
 
 
674 aa  82.4  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  26.2 
 
 
769 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.06 
 
 
818 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.39 
 
 
752 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  27.21 
 
 
672 aa  78.2  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0243  ComEC/Rec2-related protein  29.88 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.17 
 
 
775 aa  77.4  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  30 
 
 
798 aa  77  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.19 
 
 
786 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  26.69 
 
 
747 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.85 
 
 
794 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.01 
 
 
778 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  27.35 
 
 
748 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0604  putative competence locus E  32.24 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.790814  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  27.35 
 
 
748 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.16 
 
 
791 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.78 
 
 
749 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.69 
 
 
808 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.21 
 
 
771 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  28.89 
 
 
752 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  29.91 
 
 
679 aa  70.9  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.09 
 
 
797 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  22.86 
 
 
689 aa  69.7  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3672  ComEC/Rec2-related protein  27.61 
 
 
454 aa  69.7  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  25 
 
 
546 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.68 
 
 
841 aa  69.7  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.34 
 
 
868 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1711  hypothetical protein  26.42 
 
 
737 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0805358  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.62 
 
 
789 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  31.22 
 
 
493 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  28.86 
 
 
734 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.3 
 
 
750 aa  67  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  30.52 
 
 
678 aa  67  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  25.84 
 
 
734 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  29.78 
 
 
843 aa  66.2  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  29.28 
 
 
872 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  28.28 
 
 
494 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  27.04 
 
 
739 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  23.48 
 
 
531 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  27.4 
 
 
816 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  23.75 
 
 
695 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  22.66 
 
 
697 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.33 
 
 
860 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  26.56 
 
 
799 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.14 
 
 
682 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  30.41 
 
 
825 aa  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.96 
 
 
679 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003988  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  26.21 
 
 
752 aa  63.2  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  26.56 
 
 
735 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0644  ComEC/Rec2-related protein  23.89 
 
 
700 aa  63.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.851772  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0484  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.89 
 
 
736 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 
840 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2578  hypothetical protein  27.11 
 
 
763 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0251432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1958  hypothetical protein  27.11 
 
 
763 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001218  normal  0.195131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.65 
 
 
809 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2666  hypothetical protein  27.11 
 
 
763 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  26.64 
 
 
735 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1346  ComEC/Rec2-related protein  24.73 
 
 
759 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.032062  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0733  ComEC/Rec2-related protein  23.94 
 
 
400 aa  61.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00014366  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  28.5 
 
 
636 aa  60.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  26.14 
 
 
719 aa  60.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  25.6 
 
 
872 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  25.81 
 
 
503 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1470  ComEC/Rec2-related protein  29.05 
 
 
609 aa  60.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.69 
 
 
766 aa  60.1  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.13 
 
 
777 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  25.23 
 
 
672 aa  59.7  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  26.71 
 
 
551 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.04 
 
 
822 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>