146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0604 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0604  putative competence locus E  100 
 
 
416 aa  790    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.790814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3672  ComEC/Rec2-related protein  29 
 
 
454 aa  84  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347289  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1320  ComEC/Rec2-related protein  35.35 
 
 
524 aa  78.2  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.725773  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0243  ComEC/Rec2-related protein  29.27 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26 
 
 
818 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  32.24 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  26.6 
 
 
448 aa  73.6  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  25 
 
 
626 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.3 
 
 
773 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.49 
 
 
757 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.97 
 
 
791 aa  67  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.61 
 
 
780 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.91 
 
 
786 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.19 
 
 
775 aa  66.6  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  31.84 
 
 
706 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  32.34 
 
 
694 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.17 
 
 
896 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.34 
 
 
778 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.11 
 
 
773 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.67 
 
 
837 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.27 
 
 
798 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.43 
 
 
752 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  22.12 
 
 
519 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.12 
 
 
773 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.28 
 
 
759 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.89 
 
 
682 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  29.67 
 
 
816 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.56 
 
 
840 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  27.11 
 
 
604 aa  60.1  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  31.62 
 
 
593 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.29 
 
 
841 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.81 
 
 
679 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  28.45 
 
 
748 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  23.66 
 
 
879 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  28.45 
 
 
748 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  26.61 
 
 
469 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0467  ComEC/Rec2-related protein  28.46 
 
 
545 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.58 
 
 
794 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.19 
 
 
773 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  27.75 
 
 
679 aa  57  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  27.41 
 
 
734 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.07 
 
 
773 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  22.71 
 
 
531 aa  56.6  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 
771 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  31.56 
 
 
738 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  28.27 
 
 
591 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  29.22 
 
 
636 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0733  ComEC/Rec2-related protein  28.66 
 
 
400 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00014366  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  34.06 
 
 
708 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.8 
 
 
761 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  25.26 
 
 
757 aa  55.5  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20431  hypothetical protein  24.61 
 
 
711 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192171 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.12 
 
 
772 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.12 
 
 
773 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.12 
 
 
654 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.12 
 
 
772 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  23.13 
 
 
546 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  25.69 
 
 
494 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1470  ComEC/Rec2-related protein  28.24 
 
 
609 aa  54.7  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  25.12 
 
 
773 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.46 
 
 
796 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.52 
 
 
789 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  24.84 
 
 
795 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  25.34 
 
 
706 aa  53.9  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.76 
 
 
795 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30 
 
 
883 aa  53.9  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  23 
 
 
493 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.57 
 
 
797 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  26.32 
 
 
798 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  19.9 
 
 
611 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  26.7 
 
 
474 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0617  hypothetical protein  27.54 
 
 
510 aa  52.4  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  30.58 
 
 
674 aa  52.4  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0736  putative competence-related protein  26.55 
 
 
768 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2301  competence family protein  25.2 
 
 
551 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  25.9 
 
 
551 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  26.24 
 
 
678 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  27.42 
 
 
769 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  26.92 
 
 
511 aa  50.8  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1806  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.76 
 
 
804 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  28.37 
 
 
562 aa  50.4  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.48 
 
 
797 aa  50.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  26.73 
 
 
736 aa  50.1  0.00008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0304  ComEC/Rec2-related protein  33.33 
 
 
358 aa  50.1  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.03 
 
 
814 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  25.84 
 
 
720 aa  49.7  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  25.35 
 
 
503 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0374  ComEC/Rec2-related protein  26.24 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.88 
 
 
839 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  20.38 
 
 
672 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  21.02 
 
 
671 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  20.45 
 
 
502 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  21.08 
 
 
726 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.58 
 
 
770 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.22 
 
 
784 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0761  ComEC/Rec2 family protein  29.96 
 
 
419 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0064683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.71 
 
 
808 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  31.11 
 
 
531 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  24.02 
 
 
757 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.08 
 
 
777 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>